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Enregistrement W6999606686

Development of blood-brain barrier permeable luciferin analogues for in vivo bioluminescent imaging in the brain

2015· dissertation· en· W6999606686 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueIRIS · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBioluminescenceFluorescent labellingOxidation reduction
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

La bioluminescence est un procédé que certaines espèces animales utilisent pour se camoufler, attirer des partenaires ou des proies, ou se défendre contre des prédateurs. Pour émettre de la lumière, une protéine appelée luciférase catalyse l'oxydation d'une petite molécule appelée luciférine. Durant cette reaction, cette molécule est excitée et émet un photon pour retourner à son état fondamental. La bioluminescence est utilisée en biologie dans de nombreuses applications, comme pour détecter l'expression d'un gène, quantifier l'activité d'une enzyme, ou pour étudier le développement de tumeurs. Une des limitation de cette technique est que la luciférine peut difficilement atteindre le cerveau. En effet, le cerveau est protégé par la barrière hémato-encéphalique ou blood-brain barrier (BBB). Ce projet a pour but le developpement et l'évaluation de derivés de la luciférine permettant d'améliorer le passage de cette molécule à travers la BBB. Notre approche consiste à attacher par estérification un acide gras au groupe hydroxy de la luciférine afin de la rendre plus lipophile. Cette propriété permet à cette nouvelle molécule de passer plus facilement par diffusion à travers la bicouche lipidique. Une fois entrée dans la cellule, la liaison ester est hydrolysée, libérant ainsi la luciférine. Nous avons donc synthétisé et caractérisé une nouvelle classe de dérivés alkylés de D-luciférine et de son précurseur, le 6-hydroxy-2-cyanobenzothiazole (OH-CBT). Ces composés ont été obtenus par estérification avec des acides gras d'une longueur de chaîne de 5 ou 9 carbones, l'acide pentanoïque et l'acide nonanoïque. Les composés correspondants C5-luciférine, C9-luciférine, C5-CBT et C9-CBT ont été obtenus. Ces nouveaux composés ont montré qu'ils sont de mauvais substrats pour la luciférase en solution, avec pour résultat une faible émission de lumière. En revanche l'hydrolyse de l'acide gras sous l'action d'estérases présentes dans un lysat de cellules permet la libération de la luciférine et ainsi la production de bioluminescence. La bioluminescence observée in vitro dans des cellules exprimant la luciferase est supérieure à la luciférine pour nos composés C5-luciférine et C9-luciférine. Après reaction avec la D-cystéine pour former la luciférine correspondante, le C5-CBT présente également une meilleure bioluminescence que le OH-CBT dont il est dérivé. Nous supposons donc que la plus grande lipophilicité de nos composés alkylés facilite leur diffusion vers l'intérieur des cellules. Les expériences in vivo n'ont pas montré de supériorité des composés alkylés. En effet, l'intensité du signal lumineux émis depuis la region de la tête de la souris n'est pas améliorée par l'utilisation de ces nouvelles molécules. L'utilisation d'une lignée de souris qui experiment la luciferase uniquement dans le cerveau pourrait permettre une meilleure evaluation de l'aptitude des composés à traverser la BBB. Nos molécules présentent toutefois des propriétés nouvelles avec une cinétique de bioluminescence plus lente, ce qui peut être un avantage lors d'expérience nécessitant un temps d'imagerie plus important. Les prochaines étapes de ce projet consisteront à modifier la D-luciférine et le OH-CBT afin de permettre un transport actif et non passif au travers de la BBB. Il serait possible par exemple d'attacher la D-luciférine à une molécule ou à un peptide transporté de manière active vers le parenchyme cérébral.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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