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Enregistrement W7000439356

Evaluating the impact diminished SKP1 and CUL1 expression have on chromosome instability and high-grade serous ovarian cancer pathogenesis

2019· dissertation· en· W7000439356 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleofectionTSG101OlaparibGloomLafora diseaseRomidepsin
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-grade serous ovarian cancer (HGSOC) is the most common and lethal ovarian cancer subtype. Chromosome instability (CIN; an increased rate of chromosome gains and losses) is believed to play a fundamental role in the development and evolution of HGSOC. The current study aims to evaluate the underlying mechanisms responsible for inducing CIN in HGSOC. Importantly, overexpression of Cyclin E1 protein induces CIN and genomic amplification contributes to HGSOC pathogenesis in ~20% of patients. Misregulation of Cyclin E1 at the protein level (i.e. aberrant protein turnover) is also expected to be causally linked to CIN and HGSOC development, but has never been evaluated in this context. Cyclin E1 levels are normally regulated in a cell cycle-dependent manner by the SCF (SKP1-CUL1-FBOX) complex, an E3 ubiquitin ligase that includes the proteins SKP1 and CUL1. Conceptually, loss of SCF complex function stemming from diminished SKP1 or CUL1 expression is predicted to underlie increases in Cyclin E1 protein levels and induce CIN. This study evaluates the impact of diminished SKP1 or CUL1 expression in a fallopian tube secretory epithelial cell model (a cell of origin for HGSOC) using two complementary approaches (siRNA and CRISPR/Cas9). Single-cell quantitative imaging microscopy approaches were employed to evaluate changes in CIN-associated phenotypes in response to diminished SKP1 or CUL1 expression. Our data identify SKP1 and CUL1 as novel CIN genes in HGSOC precursor cells that may contribute to the early development and pathogenesis of HGSOC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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