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Enregistrement W7001334536

J-domain protein molecular chaperones in inherited cerebellar ataxia: cellular dysfunction and altered metabolism associated with loss of DNAJC29/sacsin and DNAJC3

2024· other· en· W7001334536 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueQueen Mary Research Online (Queen Mary University of London) · 2024
Typeother
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenotypeAtaxiaChaperone (clinical)Heat shock proteinCellular modelSpinocerebellar ataxiaMutationLoss functionCellular stress responseProtein aggregationCellular compartment
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteins containing a J-domain, (known as DnaJ proteins) act to recruit the Hsp70 molecular chaperone machinery to multiple cellular processes. Mutations in several J-domain proteins cause neurological disorders, that are considered “chaperonopathies” as the molecular pathology is believed to be associated with loss of chaperone activity. This thesis focuses on two of these conditions that have cerebellar ataxia as a core component of their phenotype: Autosomal Recessive Spastic Ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS), caused by mutations in the SACS gene, which encodes DNAJC29/sacsin; and an ataxia syndrome that also presents with early-onset diabetes mellitus, caused by mutations in DNAJC3. The overarching aim of this thesis was to better understand the cellular consequences of sacsin and DNAJC3 dysfunction, with a focus on metabolic pathways. The first part of the thesis investigated alterations in cellular metabolism in a neuronal cell model of ARSACS. This identified metabolic rewiring as a consequence of sacsin knockout and highlighted potential targets for therapeutic interventions, such as modulation of GABA neurotransmitter levels. Further investigation of the cellular phenotype associated with loss of sacsin, characterised disruption of the microtubule cytoskeleton and its regulators (e.g., tau), altered integrin trafficking and impaired focal adhesion dynamics. These aspects of the loss of sacsin phenotype were further investigated in the mouse retina, which was selected based on the presence of a retinal phenotype in ARSACS patients. In the final part of the thesis, a novel cellular model for DNAJC3 loss of function was developed. Molecular characterisations of this model were then performed by metabolomic and transcriptomic analysis. In summary, defining cellular deficits associated with the loss of sacsin and DNAJC3 is a valuable first step towards understanding molecular mechanism of disease and identification of potential therapeutic strategies for these ataxias. It also broadens our understanding of the cellular roles of J-domain proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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