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Enregistrement W7005782192

In search of Broad Applicable, Small Molecule Inhibitors of Salmonella Biofilm Formation. (ICAR2010)

2010· article· en· W7005782192 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueLirias (KU Leuven) · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLepidoptera: Biology and Taxonomy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmSalmonellaBacteriaSmall moleculeImmune systemMulticellular organism
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salmonella is one of the leading causes of foodborne infections worldwide. A major difficulty in the prevention and treatment of Salmonella infections is the fact that Salmonella is able to form biofilms on various biotic and abiotic surfaces. Biofilms are multicellular structures, in which the bacteria live in a self-produced gel-like matrix. Within these biofilms, Salmonella is protected against a wide range of environmental influences such as desiccation, antibiotics, disinfectants and the host immune system. As such, biofilm formation is an important survival strategy of Salmonella, both in- and outside the host. Therefore, the prevention and/or eradication of these biofilms could be an effective way to limit the spread of Salmonella. To identify new Salmonella biofilm inhibitors we conducted a high-throughput screening (using the ‘Calgary Biofilm device’) of a compound library, consisting of > 20.000 small molecules, in search of Salmonella biofilm inhibitors which are active at a temperature ranging from 16 °C to 37 °C, and therefore have potential to be used both in- and outside the host. The library contains a broad range of compounds, selected on their possible drug ability. The compounds have a molecular weight between 200 and 500 dalton and the screening was executed both at 16 °C and 37 °C, with a compound concentration between 20 µM and 50 µM. We aim at identifying compounds that inhibit biofilm formation, but that do not kill the bacteria. In this way, the development of resistance, which is a major drawback of classical antibiotics, is less likely. As such, these biofilm inhibitors could be a sustainable alternative in the production of safe and healthy food. Out of the 20.000 compounds tested, we identified 144 (0.72 %) possible biofilm inhibitors (‘hits’), of which 68 are active at 16 °C, 34 compounds at 37 °C, and 38 compounds are active at both temperatures. Subsequently, the dose-response relationship of the ‘hits’ was determined, as well as the effect of the compounds on the planktonic growth of Salmonella, using a ‘bioscreen’ (Labsystems). The compounds with maximum biofilm inhibitory activity and minimal effect on planktonic growth, were studied further, both with respect to prevention and destruction of biofilms from Salmonella Typhimurium and Pseudomonas aeruginosa, at different temperatures (16 °C, 25 °C, 30 °C and 37 °C). Using these results we identified 9 ‘lead’ families, from which analogues were purchased (± 20 analogues/family resulting in a library of 184 analogues). Using these analogues the “structure-activity relationship” of the ‘leads’ will be determined, to select and/or optimize the most potent compounds. This will yield several ‘lead-compounds’. From these ‘lead-compounds’ the activity in different in vitro and in vivo test systems will be determined, as well as the ‘Mode of Action’.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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