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Enregistrement W7005811285

The role of USP19 deubiquitinating enzyme in regulating cell proliferation

2010· dissertation· en· W7005811285 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDeubiquitinating enzymeUbiquitinCell growthUbiquitin ligaseProtein subunitEnzymeProteasomeCell
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously identified the USP19 deubiquitinating enzyme. To further characterize the functions of USP19, we used siRNA to deplete this enzyme in cultured cells. Depletion of USP19 in FR3T3 fibroblasts resulted in an impairment of cell growth, delay in entry into S phase and accumulation of p27Kip1, an inhibitor of G1 to S phase progression. This increased p27Kip1 upon USP19 depletion was due to a decrease in the rate of degradation of p27Kip1 in G0 and G1 phases, but not at the G1/S transition. The increased p27Kip1 in USP19 depleted FR3T3 cells was associated with reduced levels of KPC1, the catalytic subunit of a ubiquitin protein ligase for p27Kip1, but no changes in levels of Pirh2 or Skp2, other ligases for p27Kip1. KPC1 was ubiquitinated in vivo and stabilized by proteasome inhibitors and by overexpression of USP19, and it also coimmunoprecipitated with USP19. Cell growth impairment upon USP19 depletion was partially reversed in cell lines stably expressing KPC1 or in p27Kip1−/− MEF cells. These findings indicated that in normal fibroblasts, USP19 exerts its effects on cell proliferation through KPC1/ p27Kip1 dependent mechanisms, by deubiquitinating and stabilizing KPC1 which in turn leads to increased ubiquitination of p27Kip1, and also by a KPC1/ p27Kip1 independent pathway(s).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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