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Enregistrement W7005811285

The role of USP19 deubiquitinating enzyme in regulating cell proliferation

2010· dissertation· en· W7005811285 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDeubiquitinating enzymeUbiquitinCell growthUbiquitin ligaseProtein subunitEnzymeProteasomeCell
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nous avons précédemment décrit la protéine USP19 comme étant une enzyme de déubiquitination.Maintenant, pour mieux comprendre le rôle de USP19, nous avons réduit les niveaux de l'enzyme en utilisant des ARNs interférents dans des cellules en culture.En réduisant la protéine USP19 dans des fibroblastes FR3T3, nous avons obtenu une altération de la croissance cellulaire, ainsi qu'un délai d'entrée en phase S du cycle cellulaire et une accumulation de p27 Kip1 , un inhibiteur de la progression cellulaire de la phase G1 à S. Cette augmentation de p27 Kip1 suite à la réduction de USP19 est due à une diminution du taux de dégradation de p27 Kip1 durant les phases G0 et G1 et non durant la transition G1/S.L'augmentation de p27 Kip1 dans les cellules FR3T3 traitées avec l'ARN interférent contre USP19 est associée à une réduction des niveaux de KPC1, la sous-unité catalytique de KPC qui est une enzyme de ligation à l'ubiquitine pour p27 Kip1 .Par contre, aucun changement n'a été observé dans les niveaux de Pirh2 ou Skp2, deux autres enzymes de ligation à l'ubiquitine associée à p27 Kip1 .KPC1 est conjugué à l'ubiquitine in vivo et est stabilisé par des inhibiteurs du protéasome ou par la surexpression de USP19.KPC1 peut aussi être coimmunoprécipité avec USP19.L'altération de la croissance cellulaire suite à la réduction de USP19 peut être partiellement inversée dans des lignées cellulaires qui exprime KPC1 de façon stable ou dans des cellules MEF p27 Kip1-/-.Ces résultats nous indiquent que dans des fibroblastes normaux, USP19 exerce son effet sur la prolifération cellulaire via des mécanismes dépendants de KPC1/ p27 Kip1 et ce en déubiquitinant et en stabilisant KPC1 qui à son tour mènera à une augmentation de l'ubiquitination de p27 Kip1 .Toutefois, USP19 peut aussi exercer son effet par des voies indépendantes de KPC1/ p27 Kip1 .Pour déterminer l'importance des ces mécanismes dans d'autres types de cellules, en particulier dans des cellules cancéreuses, nous avons réduit les niveaux de USP19 dans une panoplie de lignées cellulaires, incluant des lignées v de cancer de prostate comme DU145, PC-3, LNCaP et 22RV1, des lignées de cancer du sein comme MCF7 et MDA-MB-231, d'épithélium mammaire comme MCF10A ainsi que dans des lignées transformées comme les cellules Hela et 293T.La capacité de USP19 à réguler la croissance cellulaire corrèle généralement avec sa capacité à moduler p27 Kip1 , à l'exception des cellules Hela et 293T dans lesquelles la régulation de p27 Kip1 est maintenue mais où la régulation de la croissance cellulaire est perdue.Ces effets semblent être indépendants de KPC1, Pirh2 ou Skp2, étant donné que leurs niveaux protéiques restent inchangés suite à la réduction de USP19.Ces résultats suggèrent que la transformation cellulaire peut mener à la perte de l'effet de régulation de USP19.En effet, lorsque USP19 est réduit dans des cellules FR3T3 qui ont été transformées par l'oncogène Ras, aucun effet n'est observé sur la croissance cellulaire ou sur les niveaux de p27 Kip1 ou KPC1.Par conséquent, cette étude est conceptuellement significative car elle identifie USP19 comme étant un nouveau régulateur de p27 Kip1 et de la progression G1 dans des fibroblastes normaux ainsi que dans certaines lignées cellulaires de cancer de prostate.Cette étude suggère que USP19 pourrait devenir une nouvelle cible pour le traitement du cancer de la prostate.vi

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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