Investigating the genetic basis of germline quiescence in «C. elegans» dauers
Notice bibliographique
Résumé
When faced with unsatisfactory environmental conditions, young C. elegans larvae can enter a diapause-like stage called dauer. The decision to form dauer is controlled by three parallel signalling pathways (TGF-β, cGMP and insulin/IGF-like signalling) that converge on DAF-12, a nuclear hormone receptor that prompts either dauer formation or reproductive growth depending on the environmental cues presented to C. elegans during its development. DAF-12 is related to the Vitamin D, Liver-X, and Androstane receptors, and similar to these human NHRs, responds to cholesterol-derived hormones. Ligand-bound DAF-12 has transcriptional activity directing reproductive development, while unliganded DAF-12 forms a dauer-specifying complex that regulates the transcription of genes required for dauer development with its interacting protein DIN-1S. I report here that din-1S is required in the germ cells upstream of insulin-like signalling (IlS) and in parallel to LKB1/par-4 signalling to establish dauer germline quiescence. I also observed that din-1S is important for post-dauer reproductive fitness when IlS is impaired. Moreover, I demonstrate that din-1S is necessary for long dauer life span in response to reduced insulin signalling, either downstream of, or in parallel to, AMPK/aak-2. Finally, I show that din-1S acts upstream of IlS pathway components to restrict somatic gonad precursor cell proliferation during dauer development, and uncover a conditional role for LKB1/par-4 signalling in this process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».