Quantitative (phospho)-proteomics identifies a novel role for hedgehog in reprogramming adipocyte energy metabolism
Notice bibliographique
Résumé
Der Hedgehog Signaltransduktionsweg (Hh) spielt eine essentielle Rolle in Entwicklungsprozessen von der Fruchtfliege bis hin zum Mensch. Eine unzureichende Funktion des Hh führt zu schweren Missbildungen, wobei eine Überreaktion mit Tumorentstehung in Verbindung steht. Daten unserer Forschungsarbeiten bestätigten (i) eine Schlüsselfunktion des Hh in der Inhibierung der Differenzierung weißer, aber nicht brauner Fettzellen sowohl in vitro als auch in vivo und, (ii) dass diese hemmende Wirkung durch das T-Zellen Zytokin Interferon-gamma blockiert wird. Interessanterweise hat sich bis dato keine Studie damit befasst, den Hh auf reife Fettzellen zu untersuchen und keine (phospho)-proteomischen Daten sind vorhanden. Somit setzten wir uns das Ziel, neue Mechanismen des Hh auf reife Fettzellen, mit Hilfe quantitativer proteomischer Methoden zu erfassen. 2D-PAGE und 1D-GeLC/MSMS mit (i) angereicherten Phosphoproteinen und (ii) der zytoplasmatischen Fraktion reifer Adipozyten wurde angewandt. Ziel war es, Änderungen in (De)-Phosphorylierungen beziehungsweise des Expressionsmusters in Hedgehog stimulierten Fettzellen zu detektieren. Western blot Analysen, sowie ELISA Messungen untermauerten diese Ergebnisse. Phosphoprotein-spezifische 1D- und 2D-Gele identifizierten eine hoch reproduzierbare Phosphorylierung der Pyruvate Dehydrogenase (PDH) E1 alpha in Hedgehog stimulierten Adipozyten. Passend dazu war die zugehörige PDH Kinase überexpremiert in der cytoplasmatischen Fraktion reifer Fettzellen anzutreffen. Die glykolytischen Schlüsselenzyme Phosphofructokinase und Pyruvat Kinase M2 waren ebenfalls signifikant verändert in Hedgehog behandelten Proben. Diese Änderungen zeigten einen Glukosefluss in Richtung erhöhter Laktatproduktion. Detailuntersuchungen bestätigten Änderungen der Glykolyse und der mitochondrialen Funktion und zeigten auch erhöhte NAD+/NADH und NADP+/NADPH Ratios. Schlussendlich ermittelten diese (phospho)-proteomischen Daten Hh als einen unbekannten Regulator des Energiestoffwechsels, der zu einem erhöhten Glucosedurchsatz und Laktatproduktion führt.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».