Quantitative (phospho)-proteomics identifies a novel role for hedgehog in reprogramming adipocyte energy metabolism
Bibliographic record
Abstract
Der Hedgehog Signaltransduktionsweg (Hh) spielt eine essentielle Rolle in Entwicklungsprozessen von der Fruchtfliege bis hin zum Mensch. Eine unzureichende Funktion des Hh führt zu schweren Missbildungen, wobei eine Überreaktion mit Tumorentstehung in Verbindung steht. Daten unserer Forschungsarbeiten bestätigten (i) eine Schlüsselfunktion des Hh in der Inhibierung der Differenzierung weißer, aber nicht brauner Fettzellen sowohl in vitro als auch in vivo und, (ii) dass diese hemmende Wirkung durch das T-Zellen Zytokin Interferon-gamma blockiert wird. Interessanterweise hat sich bis dato keine Studie damit befasst, den Hh auf reife Fettzellen zu untersuchen und keine (phospho)-proteomischen Daten sind vorhanden. Somit setzten wir uns das Ziel, neue Mechanismen des Hh auf reife Fettzellen, mit Hilfe quantitativer proteomischer Methoden zu erfassen. 2D-PAGE und 1D-GeLC/MSMS mit (i) angereicherten Phosphoproteinen und (ii) der zytoplasmatischen Fraktion reifer Adipozyten wurde angewandt. Ziel war es, Änderungen in (De)-Phosphorylierungen beziehungsweise des Expressionsmusters in Hedgehog stimulierten Fettzellen zu detektieren. Western blot Analysen, sowie ELISA Messungen untermauerten diese Ergebnisse. Phosphoprotein-spezifische 1D- und 2D-Gele identifizierten eine hoch reproduzierbare Phosphorylierung der Pyruvate Dehydrogenase (PDH) E1 alpha in Hedgehog stimulierten Adipozyten. Passend dazu war die zugehörige PDH Kinase überexpremiert in der cytoplasmatischen Fraktion reifer Fettzellen anzutreffen. Die glykolytischen Schlüsselenzyme Phosphofructokinase und Pyruvat Kinase M2 waren ebenfalls signifikant verändert in Hedgehog behandelten Proben. Diese Änderungen zeigten einen Glukosefluss in Richtung erhöhter Laktatproduktion. Detailuntersuchungen bestätigten Änderungen der Glykolyse und der mitochondrialen Funktion und zeigten auch erhöhte NAD+/NADH und NADP+/NADPH Ratios. Schlussendlich ermittelten diese (phospho)-proteomischen Daten Hh als einen unbekannten Regulator des Energiestoffwechsels, der zu einem erhöhten Glucosedurchsatz und Laktatproduktion führt.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".