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Enregistrement W7015013796

The role of Lkb1 in preimplantation mouse embryos

2013· dissertation· en· W7015013796 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2013
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpiblastEmbryoPhenotypeMutantEmbryonic stem cellCellEmbryogenesisBlastocystEndoderm
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

LKB1 is a tumor suppressor gene associated with a rare autosomal dominant disorder known as Peutz-Jeghers Syndrome (PJS) which is characterized by the formation of benign gastrointestinal polyps and an increased risk of development of malignant tumors. It has been shown that Lkb1 is involved in various cellular events such cell cycle regulation, cell polarity formation and epithelial morphogenesis, and energy metabolism. The role of Lkb1 in development was examined in Lkb1 KO mice. Interestingly, the homozygous mutant embryos survive up to around E9.5 and die due to vasuclogenesis defects. Although cell polarity and epithelial morphogenesis play important roles in cell allocation and lineage specification in the preimplantation embryos, no clear defect was observed.We hypothesize that lack of early phenotypes in the Lkb1 mutant embryo is because maternal loaded Lkb1 protein and mRNA are sufficient for the embryo to go through the early stages. To test this, we generated maternal/zygotic null Lkb1 embryos using the oocyte specific Cre line, ZP3-Cre (a recombinase enzyme that is active in the oocytes) with the floxed Lkb1 conditional KO mouse line. Interestingly, both maternal/zygotic-deleted homozygous (MZLkb1-/-) embryos and maternal-deleted heterozygous (MLkb1+/-) embryos established epithelial layers at E3.5 and E4.5 with clear apico-basal polarity. Although the first three cell lineages, trophoectoderm, epiblast and primitive endoderm were formed, we found a bias towards a particular cell fate; the PE lineage, at E3.5 in the both MLkb1+/- and MZLkb1-/- embryos.We also found changes in cell allocation and ICM morphology in the blastocyst. We quantified those changes and found that there is an observable spreading of the epiblast and PE tissue in both the MLkb1+/- and MZLkb1-/-) mouse embryos. Taken together, I conclude that Lkb1 does play a role in the early stages of development of the mouse embryos where it affects cell morphology and lineage specification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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