Genetic analysis of the effect of «Nramp 1» on the host and pathogen genomes in the context of chronic «Salmonella» infection
Notice bibliographique
Résumé
In humans, Salmonella infections cause two major clinical diseases: salmonellosis and typhoid fever. Silent carriage of the bacteria is frequent and contributes to disease dissemination. Using a genomic approach, we have reported the identification of ten loci (Ses1-Ses10) affecting Salmonella persistence in mice. A major locus, Ses1, was validated using a congenic approach. Nramp1 remains a strong candidate gene for Ses1 although we did not detect a significant interaction between Ses1 and Nramp1-/-. We also present the creation of new double congenic strains (Ses1/Ses4 and Ses1/Ses5) that will be used to validate the inheritance model of Salmonella clearance in females. Furthermore, the influence of Nramp1 on the transcriptome of Salmonella was investigated and diverse virulence mechanisms were shown to be involved. Notably, differential phoP expression, and the resulting differential expression of PhoP-regulated genes, was observed in the presence of Nramp1. Our results confirm the importance of host-pathogen interactions in determining the outcome of infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».