Functional and structural characterization of cytoplasmic poly(A) binding protein
Notice bibliographique
Résumé
Cytoplasmic poly(A) binding protein (PABP) binds the 3' poly(A) tail of mRNA and plays an important role in translation of genetic information.Here, I review our knowledge of PABP with a focus on the C-terminal MLLE domain, and present the results of functional and structural studies of PABP.I elucidated the interactions between PABP and its binding partner Paip2.These interactions could regulate PABP and potentially affect PABP dissociation from mRNA.I found a link between PABP and formation of P-bodies, which suggests that PABP is important in mRNA decay and remodeling of mRNA-protein complexes.I also identified a new PAM2 motif in RNArelated LARP4.Structural characterization revealed a conserved pattern of residues in the PAM2 motif and enabled us to look for additional PAM2-containing proteins.Finally, I report a study of PABP isoform specific functions.The study utilized new genome editing technology and RNA-seq analysis to detect transcriptome changes that correlate with PABP isoform usage.In all, the thesis presents multidisciplinary studies of PABP function and structure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».