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Enregistrement W7019879001

Human «ether-a-go-go» related gene trafficking is dependent on a cytosolic chaperone network

2010· dissertation· en· W7019879001 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChaperone (clinical)GeneCytosolGene expressionTransfectionEndocytosis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Long QT Syndrome is a cardiac disorder associated with ventricular arrhythmias that can lead to syncope and sudden death.Loss of function mutations in the human ether-a-go-go related gene (hERG/KCNH2) potassium channel underlie type 2 long-QT syndrome (LQT2).Most often this loss of function is a consequence of defective trafficking of hERG mutants to the cell surface, with channel retention and degradation at the endoplasmic reticulum.This study began with a proteomics screen conducted to search for hERGinteracting proteins that were important for its folding, trafficking, and degradation.The resulting list of putative interactors was huge and included several known components of the cytosolic chaperone network which became the focus of this work.Among them were Hsc70 (70 kDa heat shock cognate protein), Hsp90 (90 kDa heat shock protein), DJA1, Hop (Hsp-organizing protein) and Bag-2 (BCL-associated athanogene 2) as well as the membrane-bound FKBP38 (38 kDa FK506-binding protein; FKBP8).We first demonstrate that FKBP38 immunoprecipitates and co-localizes with hERG in our cellular system and that siRNA knockdown of FKBP38 causes a reduction in hERG trafficking.Next, we identify DJA1 (DNAJA1) and DJA2 (DNAJA2) as key modulators of hERG degradation.Overexpression of the DJAs reduces hERG trafficking

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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