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Enregistrement W7020729068

MicroRNA-135a regulation of sodium calcium exchanger gene expression in cardiomyocytes

2017· dissertation· en· W7020729068 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2017
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSodium-calcium exchangerContext (archaeology)microRNAGene expressionLuciferaseMyocyteMicroarray analysis techniquesMicroarrayMessenger RNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) are key regulators of cardiac electrical and structural remodeling and are implicated in pathologies such as arrhythmias, ischemic heart disease and hypertrophy. miRNA expression has yet to be studied in the context of complete atrioventricular block (CAVB) and the subsequent bradycardic arrhythmogenic remodeling. A time course microarray and RT-qPCR analysis of left ventricular miRNA expression in a mouse CAVB model revealed a strong, early and sustained reduction in miR-135a over 4 weeks, a miRNA unexplored in the cardiovascular field. Several other miRNAs were differentially expressed by 4 weeks post-CAVB as well.To better understand the role of miR-135a in the cardiomyocyte, we identified relevant target genes using literature searches and prediction algorithms, followed by biological confirmation using miR-135a overexpression with luciferase assays, real time qPCR and Western blot. Na+-Ca2+ exchanger 1 (NCX1), encoded by the gene SLC8A1, was identified as a regulated gene; miR-135a overexpression reduced NCX1 3'UTR luciferase reporter activity (-42%) and NCX1 mRNA (-47%) and protein (-35%) expression. Given the significance of NCX1 activity in automaticity and Ca2+ handling in neonatal cardiomyocytes, we sought to investigate the functional effects of miR-135a overexpression in spontaneously beating primary neonatal rat ventricular myocytes (NRVMs). 72-hour overexpression of miR-135a reduced spontaneous beating frequency at 33oC from 147±8 bpm (negative control) to 55±6 bpm, and caused beat-to-beat interval irregularities. Ca2+ transient measurements (fura-2 AM) demonstrated no miR-135a associated alterations when NRVMs were electrically stimulated at 2 Hz; however, rapid application of 20-mM caffeine revealed an increase in decay time constant (+54%) in miR-135a NRVMs. Additionally, the Ca2+ overloading toxic effects of 100-µM ouabain, a cardiac glycoside reliant on NCX1 activity, was eliminated by miR-135a overexpression, further reducing potentially arrhythmogenic spontaneous Ca2+ release events (SCREs). The findings of this study illustrate that miR-135a overexpression negatively regulates NCX1 expression, leading to alterations of NRVM automaticity, Ca2+ extrusion rate, arrhythmogenic Ca2+ loading and SCREs. miR-135a may contribute to pro-arrhythmic remodeling following CAVB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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