Role of double-stranded RNA binding proteins, TRBP, ADAR1 and PACT, on PKR activation and HIV-1 production
Notice bibliographique
Résumé
The interferon-induced protein kinase RNA-activated (PKR) is activated after virus infection but not during human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) infection of lymphocytes. The TAR RNA binding protein (TRBP) counteracts the inhibitory effects of PKR on HIV-1 expression and replication. In U251MG astrocytes, which are low TRBP producers, PKR is activated upon HIV-1 transfection and viral production is low. Astrocytes overexpressing TRBP express more viral proteins. Expression of adenosine deaminase acting on RNA-1 (ADAR1)-p150 and its binding to PKR are increased during high HIV-1 replication. ADAR1 also reverses PKR inhibition of HIV-1 expression and production in HEK 293T and astrocytes. DNA- and RNA-binding domains of ADAR1 are required for PKR inhibition. Surprisingly, the PKR activator protein (PACT) also reversed PKR inhibition of HIV-1 expression in HEK 293T. These results indicate that three double stranded RNA binding proteins, TRBP, ADAR1 and PACT belong to a multiprotein complex that inhibits PKR function during HIV-1 infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».