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Enregistrement W7024498622

SELECTING DAYS TO FLOWERING IN LENTIL (Lens culinaris Medik.) FOR A NORTHERN TEMPERATE CLIMATE

2022· dissertation· en· W7024498622 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUniversity Library (University of Saskatchewan) · 2022
Typedissertation
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueGroundwater and Isotope Geochemistry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuantitative trait locusLocus (genetics)Temperate climateTraitSingle-nucleotide polymorphismPopulationPhenologyAdaptation (eye)Genetic marker
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lentil varieties in western Canada are continuously improved to stay relevant as a crop. This improvement requires access to a diverse pool of genetics, of which in lentil, is difficult to use due to a lack of adaptation to our environment. Genetic markers for days to flowering (DTF), have been identified but have not yet been tested in western Canadian lentil breeding. Phenotyping DTF in Saskatchewan field experiments and mapping, using markers associated with specific loci in the lentil genome, was used to identify loci relevant to western Canadian conditions and applicable to diverse lentil germplasm. A bi-parental RIL population (LR-11) created using a Canadian line (CDC Milestone) crossed with a Bangladeshi line (ILL 8006) was phenotyped for multiple phenological traits in Saskatchewan field experiments over four site-years. A linkage map consisting of six linkage groups (LGs) was constructed using 11, 558 single nucleotide polymorphism (SNP) markers. Four quantitative trait loci (QTL) for DTF (q.DTF) were identified in more than one site-year. Of these, the two which explained the largest amount of the observed phenotypic variability each contained members of the Flowering Locus T (FT) gene family as annotated in the lentil reference genome. An exploratory expression study of these FT genes provided additional support that q.DTF.6-1 and q.DTF.6-2, may represent variation at LcFTb2 and LcFTa1, respectively. A diversity panel, AGILE-LDP, was screened with a marker representative of each of these two q.DTF and both markers accounted for differences in DTF in Saskatchewan. The inheritance patterns of the two markers, and the implied roles of LcFTb2 and LcFTa1 based on research in related legumes, provided support that the markers are accounting for at least some of the relevant variation in DTF in this panel. These q.DTF could be used to improve selection of preferred allele combinations across diverse material. This study emphasized the need for further investigation into the underlying genes and molecular pathways implicated by q.DTF in any study, and that, on their own, focusing on any one locus leaves many unanswered questions and reduces marker adoption by breeders. In addition to DTF, days to emergence, vegetative period, and reproductive period were identified as having potential for identifying additional discrete, and phenologically relevant genomic regions that should be followed up in future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,369
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,169
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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