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Enregistrement W7027228407

Characterization of differentially activated human B cells and effects of their soluble products on regulatory T cell suppressive function: assay development and design

2012· dissertation· en· W7027228407 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésT cellCD40B cellCellAntigenLigand (biochemistry)Antigen-presenting cellRegulatory T cell
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

B cell depletion therapy with rituximab significantly decreases new disease activity in multiple sclerosis (MS) patients; however, these benefits do not correlate with a reduction in circulating or cerebrospinal fluid antibody levels. These findings implicate antibody-independent, pro-inflammatory roles of B cells in MS. Furthermore, in other autoimmune diseases, such as systemic lupus erythematosus (SLE), B cell depletion reportedly resulted in increased function of circulating regulatory T (Treg) cells. Since MS patients have been found to exhibit deficient Treg function, we hypothesized that activated B cells in MS patients can abnormally suppress the function of Treg cells. Therefore, B cell depletion with rituximab allows for restored Treg function, and the prevention of new autoimmune disease activity. In particular, we postulated that the abnormal pro-inflammatory cytokine profile secreted by MS B cells was responsible for defective Treg function. To begin studying the potential relationship between B and Treg cells, I optimized and validated an in vitro human B cell activation assay, as well as a human Treg suppression assay in healthy controls, to subsequently determine the effects of supernatants from differentially activated B cells on Treg suppressive function.Human B cells were isolated using magnetic-activated cell sorting (MACS), then stimulated with B cell crosslinking antibody (X), CD40 ligand (40), a combination of the two (X40), or CpG-nucleotides. Their supernatants were collected and responses found to support previously published findings. Treg and T responder (Tresp) cells were isolated using both MACS and fluorescence-activated cell sorting (FACS) techniques; then stimulated in coculture with and without B cell supernatants; and proliferation was determined by either standard beta scintillation counting (3H-TdR) or carboxyl-fluorescein succinimidyl ester (CFSE) dilution of Tresp cells. We found that Treg cells isolated using the MACS technique contain high numbers of contaminating CD4+CD25neg Tresp cells; are non-proliferative when stimulated alone; and do not robustly suppress Tresp cell proliferation. In contrast, FACS-isolated Treg cells have higher purity and are suppressive of Tresp cell proliferation and cytokine secretion. Suppression could be modulated by treating cells with either IL-10 to promote suppression, or Pam3Cys to decrease suppression, establishing the dynamic range of the suppression assay. When supernatants from B cells activated with CpG-nucleotides or CD40 ligation were added to the suppression assay, we did not find any significant changes. As such, this may reflect a more subtle biology than can be captured within this assay and still requires further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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