Evolution in natural populations: Molecular marker-based inference of life history and quantitative genetic data
Notice bibliographique
Résumé
I develop and apply techniques that use molecular markers to infer critical evolutionary patterns in natural populations in general, and in particular to brook charr, 'Salvelinus fontinalis', inhabiting Freshwater River, Cape Race, Newfoundland. To facilitate quantitative genetic and other evolutionary analyses, I developed techniques to aid in the collection of pedigree information and to facilitate power and sensitivity analyses. Based on estimates of genetic differentiation and direct estimates of individual movement Freshwater River brook charr are uniformly and relatively mobile throughout their life cycle. Using molecular markers to infer the relationship between body size and reproductive success, I obtained qualitatively different predictions of optimal life histories from previous estimates for which such molecular data and techniques were not available. My estimates suggest that early maturity is adaptive in this population, relative to estimates that have not been informed by molecular data to relate body size to reproductive success. My estimates explain some of the variation in age at first maturity in Freshwater River brook charr, and furthermore provide the first example of a qualitative difference between optimal life histories as evaluated with and without the use of molecular markers. Finally, I used molecular markers to provide both pedigree information and fitness information, via the recognition of surviving individuals, to measure natural selection on genetically-based variation in body size in Freshwater River brook charr. These pedigree and survival data allowed me to attempt the first explicit use of estimated genetic covariances to remove bias in estimates of natural selection due to environmentally-induced relationships among phenotypic variation and fitness components. I obtained no evidence of a relationship between body size and viability at either phenotypic or genetic levels. Thus the evolution of body size is at least partially constrained by a lack of selection and the currently observed distribution of growth rates is resolvable with the form of viability selection in this system. However I showed that body size is positively phenotypically related to early maturity, which I have shown to be adaptive in this study system. Thus the lack of evolution of larger body size and of earlier maturation remains unexplained.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,021 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».