MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7028813650

Genetic analysis of the rapid expansion of the Banded Killifish (Fundulus diaphanus) in Illinois

2021· article· en· W7028813650 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueIDEALS (University of Illinois Urbana-Champaign) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubspeciesKillifishEndangered speciesThreatened speciesHouse mousePopulation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent investigations into the rapid expansion of Banded Killifish (Fundulus diaphanus)
\nin Illinois has brought to light significant conservation implications. Previous data suggested
\nthat Illinois should be inhabited by the Western subspecies of Banded Killifish (F. d. menona),
\nthough morphological data from recently encountered populations reveals some populations might be comprised of the Eastern subspecies (F. d. diaphanus) and/or subspecies hybrids. Until
\nnow, the Illinois Endangered Species Protection Board has not had to recognize subspecies, and
\nit was possible the recent expansion of Banded Killifish populations throughout Illinois could
\nhave led to the removal of its threatened status, regardless of the subspecies responsible for
\nthe expansion. The goal of our project was to investigate the genetic composition of expanding populations of Banded Killifish across Illinois, with an emphasis on determining whether this recovery of a rare taxa is of the native Western subspecies, an invasion of the non-native Eastern subspecies, or whether hybridization between subspecies is occurring. We compared the molecular characteristics of Banded Killifish populations in Illinois and surrounding areas to those from within the native ranges of the Western Banded Killifish and Eastern Banded Killifish. We collected Banded Killifish between 2017 and 2020 from nearly 100 sites around the Midwest – kettle lakes, southern Lake Michigan basin, the Chicago Area Waterway System (CAWS), upper Illinois River, lower Rock River, and Mississippi River – as well as areas representing known Western (e.g., Iowa, Minnesota) and Eastern (e.g., Maryland, Canada) subspecies. Genomic material was extracted from muscle tissues via common extraction kits and protocols and included the mitochondrial D-loop and nuclear X-src intron. Our results show that there are three conservation management units within Illinois – 1) the kettle lake region of McHenry and Lake counties, which is the only area not influenced by the non-native Eastern Banded Killifish; 2) the Lake Michigan – CAWS – Illinois River (including Wolf Lake and Powderhorn Lake in Cook County) population that is predominately made up of the Eastern subspecies and hybrids; and 3) the Mississippi River (including lower Rock River) population, which contains both subspecies as well as subspecies hybrids. Our data should provide the resource managers of Illinois a complete understanding of the expansion of Banded Killifish in Illinois and provide a crucial step in conserving the native Western Banded Killifish, while recognizing the existence of a non-native taxa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,369
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueIDEALS (University of Illinois Urbana-Champaign)Même sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207