Identification and characterization of the novel homedomain-containing transcription factor PREP2
Notice bibliographique
Résumé
Transcription factors encoded by the Hox gene family are conserved throughout the animal kingdom. Their differential spatial and temporal expression is crucial for axial patterning in early embryonic development. The affinity and specificity of DNA-binding by the homeodomain (HD)-containing HOX proteins is raised by interaction with cofactors. The three-amino-acid-loop-extension (TALE) class of HD-containing proteins comprises HOX-cofactors which are further categorized into subfamilies including the PBC family, the MEIS family and the PKNOX/PREP family. HOX-cofactors belonging to the TALE class have been shown to form dimeric or trimeric complexes with other TALE family members and with HOX proteins to regulate Hox target genes. It is the composition of these complexes that controls their stability, target gene selectivity and recruitment of coregulators, and finally determines Hox-dependent developmental programs. We used the proto-oncoprotein PBX, which belongs to the PBC family, to identify new PBX-interacting partners in a yeast-two-hybrid approach. In this process, we identified a novel member of the PREP family, which we designated PREP2. PREP2 is ubiquitously expressed during embryonic development and exists in multiple isoforms that localize to different subcellular compartments as revealed by two antibodies that we raised against the N and C-terminus of the protein. The subcellular distribution is regulated by several non-exclusive mechanisms including active nucleocytoplasmic transport, cytoplasmic retention, protein-protein interaction as well as phosphorylation. Most strikingly, the actin as well as the tubulin cytoskeleton seem to be involved in this regulatory process, hence representing a novel means of regulation for a TALE class protein. In an attempt to identify the various PREP2 isoforms, we cloned and characterized a splicing variant -PREP2/E12- that has the potential to act as a dominant negative. Interestingly, PREP
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».