MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7029245389

Introgression of blackleg resistance genes from related Brassica species to B. napus

2024· dissertation· en· W7029245389 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2024
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlacklegLeptosphaeria maculansBrassicaCanolaIntrogressionPlant disease resistanceCultivarResistance (ecology)Pathogen
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Canola (Brassica napus L.) is one of the most important oilseed crops, contributing more than $26 billion annually to the Canadian economy. Blackleg is caused by fungal plant pathogen Leptosphaeria maculans (Desm) Ces. et de Not. In canola, blackleg disease causes more than $1 billion in yield losses globally. There are different disease management strategies, and using resistant cultivars is one of the economically viable and environmentally sustainable approaches. There are reports of a breakdown of blackleg disease resistance in Australia, France, and Canada due to severe pathogen pressure. Twenty-two blackleg-specific resistance genes have been identified in different Brassica species. Out of these, the B-genome blackleg-specific resistance genes provide resistance throughout a plant's life. This thesis addresses the identification of putative novel sources of resistance from Brassica juncea and hexaploid Brassica into B. napus. In the first project, different B. juncea UM lines were used to identify a high level of resistance against blackleg disease and were screened with L maculans isolate 03-15-03 (AvrLm2, AvrLm3, AvrLm5-9, AvrLm6, AvrLm10, and AvrLm11) and PG4-1-M (AvrLm2, AvrLm5-9, AvrLm6, AvrLm10, and AvrLm11). Plants were inoculated with different L. maculans (AvrLm3 and avrLm3; AvrLm5 AvrLm6, AvrLm5 avrLm6, and avrLm5 avrLm6) isolates to identify the novel source of resistance in Brassica napus Westar x Brassica juncea UM3073 (UMBJ16) genotypes. For genotyping, UMBJ16 genotypes were tested for all the available blackleg-specific resistance gene-linked Kompetitive Allele-Specific PCR (KASP) (Rlm1, Rlm2, Rlm3, Rlm4, Rlm7, Rlm9, LepR1, LepR2, LepR3, and LepR4) and Simple Sequence Repeats (SSR) markers (Rlm6 and rjlm2). In the second project, the B-genome blackleg-specific resistance genes were introgressed from hexaploid Brassica into B. napus. Similar phenotyping and genotyping approaches were followed to identify the putative novel source of resistance against L. maculans isolate 03-15-03 and PG4-1-M in Brassica napus Westar x hexaploid Brassica crosses (BNHB16). This resulted in the identification of a putative novel source of resistance against L. maculans isolate PG4-1-M in UMBJ16 and BNHB16 genotypes. This newly developed germplasm will help to develop blackleg-resistant breeding material in canola and rapeseed breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMspace (University of Manitoba)→Même sujetPlant-Microbe Interactions and Immunity→Travaux en français237 207→