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Enregistrement W7033666151

Sacsin deletion disrupts Golgi organization and Autophagy in C6 rat glioblastoma cells

2022· dissertation· en· W7033666151 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUniversidade Nova de Lisboa's Repository (Universidade Nova de Lisboa) · 2022
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAvian ecology and behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyUnfolded protein responseProtein aggregationParkinAutophagy-related protein 13Cell cultureEndoplasmic reticulumVacuolar protein sorting
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal recessive spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS) is a rare childhood-onset ataxia characterized by progressive cerebellar ataxia, spasticity, motor sensory neuropathy and axonal demyelination. ARSACS is caused by mutations in the SACS gene, which leads to the production of defective forms of the 520 kDa multidomain protein sacsin. C6 rat glioblastoma cells were targeted for sacsin deletion by means of CRISPR/Cas9 technique to generate an astroglial model of ARSACS. Sacsin knockout cell lines were isolated by Flow Cytometry-assisted Cell Sorting and sacsin loss was subsequently confirmed in further experiments. Intermediate filaments (IF) expression levels were analyzed upon serum starvation and incubation with IL-6 and BMP2 cytokines, while IF aggregation and their disruption on organelle organization was observed by immunocytochemistry. C6 SACS-/- cells revealed an increase in expression of IF proteins and aggregation of nestin in the juxtanuclear area. Golgi apparatus was often pushed out of the perinuclear area and disarrayed in SACS-/- cells. STAT3 and SMAD1/5 signalling was altered in C6 SACS-/- cells in response to cytokines. The expression of the alarmin protein S100B was significantly higher in C6 SACS-/- cells. The expression of the cytosolic form of the autophagy protein LC3-I was identical in both cells lines but the levels of the activated LC3-II form was reduced in C6 SACS-/- cells, indicating alterations in the autophagy flux. ER stress pathways were also analyzed for possible novel phenotypes in ARSACS cells. The expression of the Unfolded Protein Response (UPR)-related protein Bip did not differ for both C6 strains. CHOP had an increased expression in reference C6 cells in normal conditions but was unexpectedly not expressed in conditions of serum starvation. Withaferin A (WFA), a drug known to bind and disorganize the type III IF vimentin, disrupted Nestin filaments and induced Golgi dispersion similar to C6 SACS-/- cells. In conclusion, lack of sacsin protein disrupts glial intermediate filament assembly and intracellular organelle distribution, enhances S100B expression and impairs autophagy, while being inconclusive regarding ER stress. These results suggest a potential function for sacsin in glial cells and may have implications for treating ARSACS as well as a variety of human illnesses caused by the disruption of intermediate filament networks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,518
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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