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Enregistrement W7033676160

RNA binding protein SRRM 2/3/4 is required for e2f1b splicing in Drosophila

2025· dissertation· en· W7033676160 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2025
Typedissertation
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueCaribbean and African Literature and Culture
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNA-binding proteinRNA splicingPoly(A)-binding proteinBinding proteinPlasma protein bindingRNASplicing factorDrosophila (subgenus)Drosophila melanogasterExonic splicing enhancer
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

E2f1 is a transcription factor necessary for the regulation of cell cycle related checkpoints and activities.Drosophila melanogaster is known to have two activator e2f1 isoforms, produced by alternative splicing: e2f1a and e2f1b.E2f1b contains a 16aa microexon (termed 3b) in the MB domain that is spliced via unknown alternative splicing mechanisms.In this thesis, I report my studies on neural RNA binding protein SRRM 2/3/4 as a regulator and promoter of e2f1b specific splicing.Studies were carried out in larval tissues using molecular methods such as qPCR, immunofluorescence, in situ hybridization, RNA interference, and confocal microscopy to better understand the scope of SRRM 2/3/4's regulatory influence on alternative splicing of e2f1.My data suggests that SRRM 2/3/4, although not majorly involved in the salivary gland as opposed to neural tissues, promotes inclusion of micro exon 3b in the salivary gland.Additionally, srrm 2/3/4 RNAi salivary glands are marked by disrupted cell cycles in srrm 2/3/4 RNAi salivary glands, diminished PCNA-GFP activity, which recapitulates many aspects of the e2f1b-deficient salivary glands.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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