Structural analyses of the putative mannosylphosphate transferase, Ktr6p from «Saccharomyces cerevisiae»
Notice bibliographique
Résumé
The post-translational addition of sugar moieties onto proteins plays an important role in protein folding, secretion, signaling, and is even thought to partake in cell-cell adhesion.In eukaryotes, the biosynthesis of N-glycans begins with the transfer of Glc 3 Man 9 GlcNAc 2 to the amide group of an asparagine situated in the tripeptide Asn-X-Thr(Ser), of a protein.Subsequent removal of three glucoses and one mannose occurs in the Endoplasmic Reticulum.In yeast, those proteins that require further maturation, e.g.those destined to enter the secretory pathway, are sent to the cis-Golgi.The core, Man 8 GlcNAc 2 , is then decorated with additional mannoses and mannose-1-phosphates.The enzyme responsible for the transfer of mannose-1-phosphate in Saccharomyces cerevisiae is Ktr6p.It is a member of the Kre Two Related family of mannosyltransferases: Kre2p.Ktr6p shares 38% sequence identity with Kre2p, suggesting a similar three-dimensional structure.However, greater than 50% of the residues in the Ktr6p putative active site differ from Kre2p, signifying that Ktr6p may have a modified mannosyltransferase function.For these aforementioned reasons, crystallographic studies on this putative mannosylphosphate transferase are pursued.Here, we present the methods employed to obtain the final Ktr6p crystal structure that has been solved, via molecular replacement, to a resolution of 3.11 .A detailed discussion analyzing the results obtained ensues.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».