Understanding the impact of uncertain mismatch repair-deficient results for individuals undergoing screening for Lynch syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Background: In Manitoba, patients diagnosed with colorectal (CRC) or endometrial cancer are screened for Lynch syndrome (LS) using mismatch repair immunohistochemistry (MMR-IHC). In a number of screen positive cases (deficient MMR or dMMR), however, a pathogenic variant associated with LS cannot be identified. The implications of dMMR results are uncertain, as LS cannot be confirmed or ruled out and few guidelines are available regarding interpretation and clinical management. Assessment of the impact of these results on clinicians and patients is needed. We aimed to describe the characteristics of the Manitoba cohort of patients with these uncertain results and how these results have affected individuals. Methods: This study employed a mixed-methods parallel convergent design. Electronic records were searched for patients with dMMR results who were seen in the Shared Health Program of Genetics and Metabolism between 2013 and May 2022. Data extracted from charts included demographics, cancer diagnoses, mode of ascertainment, genetic test results, pedigree review and classification, and details from clinic letters. Qualitative interviews with a subset of patients were conducted to explore experiences with these results. Results: Two-thirds of the cohort (n = 124) were ascertained through the provincial LS screening program. 59.5% did not meet family history criteria for LS, and 50.4% would not have otherwise been eligible for genetic testing based on the Prediction Model for Gene Mutations (PREMM5). Only 25.9% of patients who had a personal and/or family history of CRC received colonoscopy recommendations for themselves, while 89.6% received advice for relatives. Four categories describing experiences with receiving genetic testing results were identified through individual interviews: experiences with testing, varying interpretations, future cancer risk perception, and important elements of a genetic counselling appointment. Participants interpreted their results in one of three ways, leading to different perceptions of future cancer risk. There was consistency between participants’ interpretations of results and how results were communicated to them. Conclusions: Patients with unexplained dMMR have varying interpretations of their genetic test results, leading to ongoing concerns about LS. Traditional family history criteria may be useful post-testing. Personal and/or family history of CRC may guide more consistent colonoscopy recommendations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,040 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».