MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7036270445

Biochemical analyses of the wrch atypical rho family GTPases: Methods Enzymol.

2006· article· en· W7036270445 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueNPARC · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytochemistry and Biological Activities
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGTPaseCDC42Ras superfamilyEffectorFunction (biology)GTPase-activating proteinGuanine nucleotide exchange factorGTP-binding protein regulatorsSmall GTPase
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Rho family of GTPases comprises a major branch of the Ras superfamily of small GTPases. To date, at least 22 human members have been identified. However, most of our knowledge of Rho GTPase function comes from the study of the three classical Rho GTPases, RhoA, Rac1, and Cdc42. These Rho GTPases function as GDP/GTP-related binary switches that are activated by diverse extracellular signal-mediated stimuli. The activated GTPases then interact with downstream effectors to regulate cytoplasmic signaling networks that in turn regulate actin organization, cell cycle progression, and gene expression. Recently, studies have begun to explore the regulation and function of some of the lesser-known members of the Rho GTPase family. Wrch-1 (Wnt-regulated Cdc42 homolog-1) and the closely related Chp (Cdc42 homologous protein)/Wrch-2 protein comprise a distinct branch of the mammalian Rho GTPase family. Although both share significant sequence and functional similarities with Cdc42, Wrch proteins possess additional N- and C-terminal sequences that distinguish them from the classical Rho GTPases (Cdc42, RhoA, and Rac1). We have determined that Wrch-1 and Wrch2 exhibit unusual GDP/GTP binding properties and undergo posttranslational lipid modifications distinct from those of the classical Rho GTPases. In this chapter, we summarize our experimental approaches used to characterize the biochemical properties of these atypical Rho GTPases

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,471

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNPARCMême sujetPhytochemistry and Biological ActivitiesTravaux en français237 207