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Enregistrement W7037654864

Environmental Mycobacteria

2009· dissertation· en· W7037654864 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUtrecht University Repository (Utrecht University) · 2009
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFern and Epiphyte Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParatuberculosisMycobacteriumVirulenceDiseaseIngestionEnteritisGenetic predispositionClinical diseaseManure
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Johne’s Disease is a debilitating chronic enteritis caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map), and has great economic impact on affected dairy farms.1, 2 \nInfection occurs in young calves, by exposure to manure from mature Map-shedding cattle. To reduce infection status on farms, prevention plans are in order, because no treatment is available for Johne’s Disease. Prevention plans for Johne’s disease rely on age-dependent susceptibility, with a cut-off at the age of six months. This cut-off is based on one paper from 1975, where only 9 animals were included in the experiment3. \nIn a clinical trial at the University of Calgary this age dependent susceptibility is being investigated with a larger number of animals: 34 male Holstein-Friesian calves are subject of a research to age- and dose dependent susceptibility to infection with Map. They will be infected with a virulent Map strain at 5 different ages (2 weeks, 3-6-9 and 12 months) with a high-(5 x 109 CFU) and a low inoculum dose (5 x 107 CFU).\nBesides this pathogenic mycobacterium, there are also environmental mycobacteria where young calves are exposed to. These mycobacteria can be found in a wide variety of environmental reservoirs, including natural and municipal water, soils, aerosols and protozoans.4 Because of ingestion and close contact with these reservoirs, environmental mycobacteria can also be found in animals and humans. \nEvidence exists for a cross-reaction in immunity between rapid growing environmental mycobacteria and other pathogenic mycobacterial species (tuberculosis and leprosy) in humans4. That’s why we are interested in the impact of environmental mycobacteria on the infection with Map in calves. \nThere are different protocols known for isolating mycobacteria from water, soil or milk5, 6, but there is none for isolating mycobacteria from faeces. \nThat was the aim of this study: to identify an appropriate protocol to isolate different mycobacteria from faeces. Mycobacterium smegmatis was used as a model for rapid growing mycobacteria. \nUnfortunately, no perfect protocol was found. An important conclusion of this research is that HPC (Hexadecyl Pyridinium Chloride), frequently used to isolate Map from faeces, is not appropriate to isolate environmental mycobacteria, because M. smegmatis does not survive concentrations higher than 0,1%, and other faecal bacteria do.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,863
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,143
Écart entre enseignants0,138 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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