Genomic characterization of wild barley germplasm
Notice bibliographique
Résumé
Barley (Hordeum vulgare subsp. vulgare) is an important cereal crop grown worldwide for producing malt and is used as animal feed. Wild barley (Hordeum vulgare subsp. spontaneum), the progenitor species of cultivated barley, is a rich source of genetic variation, which can be utilized for the improvement of cultivars. Various molecular markers are available to study genetic variability and diversity in plants. We used two different types of SSR or microsatellite markers- genomic SSRs (gSSR) and expressed sequence tag SSR (EST-SSR) markers, to assess and compare the genetic diversity between the wild and cultivated barley germplasm obtained from PGRC genebank, Saskatoon. A total of 48 genomic (gSSR) and 16 EST-SSRs were applied on 27 wild and 20 cultivated barley accessions. Based on the results, genomic (SSRs) were more informative than EST-SSRs and wild barley possessed more genetic diversity as compared to cultivated barley. Various species specific alleles were found to be higher in number in wild barley. Also, both endogenous and exogenous transposons were explored, so as to develop novel gene capturing tools in wild barley genome. In this, Mu like (MULEs) transposons were found to be endogenously present in certain important domesticated traits and Ac/Ds transposons system was introduced through conventional hybridization procedure into the wild barley germplasm, so as to utilize these mobile elements as functional genomics tools. In addition, transposons based markers were also employed to assess genetic diversity between wild and cultivated barley. All these efforts of molecular characterization of wild barley's genome will aid in the improvement of modern cultivated barley species by ultimately introgressing useful genes from wild barley species into cultivated barley.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».