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Enregistrement W7038249055

Genetic structure of the genus Milicia: taxonomy, phylogeography, population dynamics

2012· dissertation· en· W7038249055 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueORBi (University of Liège) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgence Universitaire de la FrancophonieFonds De La Recherche Scientifique - FNRSAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésGenetic structurePopulationBiological dispersalPhylogeographyGenetic diversityRange (aeronautics)Reproductive isolationSeed dispersalIsolation by distance
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Characterizing population genetic structure using phylogeographic approach contributes to understanding of evolutionary processes that affect plant populations. The present study investigated how past environmental variations can shape the spatial genetic diversity of an African timber tree species, Milicia excelsa (Welw) C.C. Berg. Given that plant responses to disturbances are closely linked to life history traits, this research also aimed to describe relationships between the reproductive traits of M. excelsa and its population genetic structure. Phylogeographic analyses were performed throughout the range of M. excelsa using nuclear and chloroplastic markers. Ecological characterization was conducted for a single population located in south-East Cameroon. Since M. excelsa is similar to the other species of its genus, M. regia (A. Chev) C.C. Berg, we first performed a morphogenetic comparison of these two taxa. The results confirmed an important morphological similarity between the two species with very rare discriminating criteria. In fact Bayesian assignment methods and reproductive isolation patterns suggest the occurrence of interspecific hybridization, which appeared to be unidirectional: hybrids displayed the M. regia morphotype. Because M. regia is known to be more adapted to humid tropical forests, one may expect it to occur in the Congo basin zone. However, its range is restricted to the western part of West Africa while M. excelsa occurs from Guinea-Conakry to Zimbabwe. Interestingly, in the case of M. excelsa, Central and West African specimens had no shared haplotype. This result was unexpected because long gene dispersal distances were found in Cameroonian populations, as expected from the behaviours of the main dispersal animals we identified, the bat Eidolon helvum and the parrots Psittacus erithacus and Agapornis swindernianus. In general, despite the likelihood for long distance seed dispersal, distinct genetic clusters were identified over West and Central Africa and their location may support the forest refugia hypothesis. In addition a phylogeographical signal was detected in chloroplast DNA indicating a prolonged separation between West and Central Africa populations with an accumulation of new mutations. At a smaller spatial scale, patterns of genetic structure also seemed to be weakly influenced by divergent reproduction times among sympatric individuals. The level of genetic diversity in the study populations falls within the range of values calculated for other tropical tree species. If phylogeography helps to infer population history, it also requires ecological or biological information to confirm some uncertainties. Such detailed data were often lacking to completely interpret numerous of our results. The present study raised new questions and led to new perspectives for further investigation both in phylogeography and botany.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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