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Enregistrement W7040174342

Novel mechanisms of regulation of the Cdc42 GTPase- activating protein CdGAP/ARHGAP31, a protein involved in cell migration and adhesion

2011· dissertation· en· W7040174342 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2011
Typedissertation
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueHistorical Architecture and Urbanism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchMedical Research CouncilNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthDeutsche ForschungsgemeinschaftCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchMcGill UniversityFaculty of Medicine, McGill UniversityBritish Heart FoundationWellcome Trust
Mots-clésCDC42Cell migrationGTPaseGTPase-activating proteinCell adhesionPlasma protein bindingRHOAProtein domainCellMotility
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Rho GTPases form a family of enzymes that control numerous cellular processes including cell migration and proliferation through effects on the cytoskeleton, membrane trafficking and cell adhesion. The activity of these molecular switches is modulated by GTPase-activating proteins (GAPs), a group of negative-regulators which includes Cdc42-GTPase-Activating Protein (CdGAP). This protein specifically negatively-regulates the Rho GTPases Cdc42 and Rac1. In this study, we show that CdGAP is regulated by lipid-, protein- and intramolecular-interactions. First, we demonstrate that a polybasic region (PBR) of CdGAP preceding the GAP domain and found in numerous Rho family GAPs is required for CdGAP specific association with phosphatidilinositol-3,4,5-trisphosphate (PI(3,4,5)P3). We show that the binding of PI(3,4,5)P3 is required for CdGAP-mediated GAP activity in vitro, and that an intact PBR is required for its CdGAP-mediated GAP activity in vivo. Second, we characterize the binding site for the negative-regulator of CdGAP Intersectin-1 located in the Basic-Rich (BR) domain of CdGAP. We present evidence that this interaction mediated by the SH3D domain of Intersectin requires one to three lysine residues located in the Basic-Rich (BR) domain of CdGAP. Thirdly, we show that CdGAP is negatively-regulated by its C-terminal domain. This observation is part of a study that links two human CdGAP gene mutations to a syndrome which presents a combination of aplasia cutis congenita (ACC) and terminal transverse limb defects (TTLD). In this syndrome, the deletion-mutant gene products which lack the residual amino-acid of CdGAP at its C-terminus have an increased activity compared to wild-type proteins. We show that this C-terminus can bind to the GAP domain of CdGAP, providing a model to explain how the absence of the C-terminus induces this syndrome. In summary, this work provides novel insight into understanding the mechanisms of regulation of CdGAP, a protein involved in cell migration and adhesion with unexpected roles related to human diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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