Novel mechanisms of regulation of the Cdc42 GTPase- activating protein CdGAP/ARHGAP31, a protein involved in cell migration and adhesion
Bibliographic record
Abstract
Les Rho GTPases forment une famille d'enzymes qui contrôlent de nombreux processus cellulaires, tels que la migration cellulaire et la prolifération, grâce à leurs effets sur le cytosquelette, le trafic membranaire et l'adhésion cellulaire. L'activité de ces interrupteurs moléculaires est modulée par les protéines activatrices de GTPases (GAPs), un groupe de régulateurs négatifs qui inclu CdGAP (Cdc42-GTPase activating protein). Cette protéine régule négativement les Rho GTPases Cdc42 et Rac1 de façon spécifique. Dans la présente étude, nous montrons que CdGAP est régulée par des interactions lipidiques, protéiques et intramoléculaire. Premièrement, nous démontrons qu'une région polybasique (PBR), précédant le domaine GAP et retrouvée dans plusieurs GAP de la famille Rho, est requise pour l'association spécifique de CdGAP avec le phosphatidilinositol-3,4,5-trisphosphate (PI(3,4,5)P3). Nos résultats suggèrent que l'activation des GAP requiert la liaison du PI(3,4,5)P3 à CdGAP dans un contexte in vitro et un PBR intact pour que CdGAP provoque ses effets GAP-dépendants dans un contexte in vivo. Deuxièmement, nous caractérisons le site de liaison du régulateur négatif de CdGAP Intersectin-1. Ce site est localisé dans le domaine riche en résidus basiques (BR) de CdGAP. Nous suggérons que cette interaction, médiée par le domaine SH3D d'Intersectin, requiert de un à trois résidus lysine dans le domaine BR de CdGAP. Troisièmement, nous montrons que CdGAP est régulé de manière négative par son propre domaine C-terminal. Cette observation fait partie d'une étude qui associe deux mutations humaines du gène CdGAP à un syndrôme présentant une combinaison d'aplasie cutis congenita (ACC) et de malformation des doigts et des orteils (TTLD). Les gènes mutants produisent des protéines tronquées qui ont une activité GAP supérieure à la protéine de type sauvage. Nous montrons que ce C-terminal peut lier le domaine GAP de CdGAP, supportant un modèle expliquant comment l'absence du C-terminal induit ce syndrome. En bref, ce travail présente un nouvel aperçu des mécanismes de régulation de CdGAP, une protéine impliquée dans la migration cellulaire et dans l'adhésion des cellules en plus d'être directement impliquée dans une maladie humaine.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".