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Enregistrement W7042869132

Quantitative variation in Drosophila melanogaster wing shape and size

2023· dissertation· en· W7042869132 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMacSphere (McMaster University) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueMorphological variations and asymmetry
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationGenetic dataAlleleCistronIdentification (biology)Selection (genetic algorithm)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several studies examining the genetics of adaptation have identified single alleles, of large phenotypic e ect, contributing to divergence between populations. This empirical finding is consistent with predictions made by the geometric model of adaptation, where a small number of alleles of large e ect and many alleles of small e ect are fixed as the population adapts. However, these examples of single genes of large e ect may represent a biased sample of the alleles of adaptation with polygenic allele shifts having a greater contribution than currently understood. Increasing power to detect smaller e ect variants, due to falling sequencing costs and improved statistical methods, has made the contribution of small allele frequency shifts at many loci, or polygenic adaptation, more apparent. In contrast to models predicting single genes of large e ect with large allele frequency changes, polygenic adaptation allows for small allele frequency changes across many alleles of small e ect to contribute to phenotypic change. Using artificial selection, I demonstrate the alignment of genetic e ects contributing to wing shape variation within a developmental pathway but a lack of replication of these same genetic e ects in other wild-caught populations. Secondly, using advanced intercross QTL mapping between altitudinally diverged populations, I demonstrate a polygenic basis for wing shape and size variation. Finally, using comparative developmental biology I investigate how change to cell size and number in the wing may contribute to divergence between high and low altitude populations. Together, this work provides evidence for many alleles of small e ect rather than alleles of large e ect contributing to adaptive divergence of wing shape and size and provides context for identified alleles through replication in other populations and comparative developmental biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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