Searching for HES6 dimerization partners
Notice bibliographique
Résumé
HES6 is a novel member of the basic helix-loop-helix (bHLH) family of transcription factors that is involved in the activation of the myoblast differentiation program. Studies demonstrated that HES6 can regulate transcription from gene promoters containing an N box (CACNAG), a DNA motif located in the regulatory regions of many muscle-specific genes involved in myoblast differentiation. This suggested that a HES6 heterodimer could bind to the N box. The purpose of this study was to identify putative HES6 dimerization partners that would allow it's binding to the N box and then repress transcription. A genome-wide screen isolated several clones. Potential positive clones, the heat shock proteins HSP169 and HSP70 were identified. The functional significance of this interaction remains to be determined. A candidate gene approach allowed detection of an interaction in vivo between HES6 and a novel hairy-related bHLH protein, CHF2. This interaction was detected by co-immunoprecipitation using the first specific anti-HES6 antibody synthesized. Electrophoretic mobility shift assays revealed that the heterodimer was unable to bind to any of the N-boxes present in the 5'-flanking region of CHF2, which was confirmed by assessing the specificity of the controls used in the experiments. It was suggested that HES6 sequesters CHF2 by the formation of an inactive heterodimer. Although a band shift was observed when incubating each of the Nboxes in the presence of total cell extract from differentiated C2C12 cells, it was not confirmed whether HES6 was one of the proteins binding to the oligonucleotides. This work has identified a novel interaction between HES6 and CHF2 and our data suggests that this interaction lead to formation of inactive heterodimers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».