Analysis of amensalistic bacteria biocontrol models
Notice bibliographique
Résumé
We present a mathematical model for growth and control of facultative anaerobic bacterial biofilms in the context of an amensalistic microbial systems. The growth of the microbial population is limited by protonated acids and the local pH value, which in return are altered as the microbial population changes. The process is described by a system of five coupled non-linear differential equations for the dependent variables biomass densities, acid concentration, pH and malate. We present an extensive model in chemostat format of this bio control model and study the effect of initial values and flow rate for the dynamics of pathogens and control agent. Using a nonlinear master equation a diffusion-reaction model for biofilms is derived. The equation for bacterial biomass shows two non-linear diffusion effects, a power law degeneracy as the dependent variable vanishes and a singularity in the diffusion coefficient as the dependent variable approaches its a priori known threshold. The interaction of both effects describes the spatial spreading of the biofilm. The interface between regions where the solution is positive and where it vanishes is the biofilm/bulk interface. We adapt a numerical method to explicitly track this interface in 'x-t' space, based on the weak formulation of the biofilm model in a moving mesh frame. Morever we present numerical simulations of the spatio-temporal amensalistic biofilm model, applied to a probiotic biofilm control scenario. An existence of solution and 2D simulation was carried out in appendix B for dual species setup.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».