MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7045233164

Adult genetic leukoencephalopathies: identifying new entities using advanced MRI techniques, next generation sequencing and clinical profiling

2019· dissertation· en· W7045233164 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéBundesministerium für Bildung und ForschungZonMwOntario Genomics InstituteCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreGenome CanadaOntario GenomicsChildren's Hospital FoundationAmerican Society of NeuroradiologyMcGill University
Mots-clésWhite matterExome sequencingLeukoencephalopathyGenetic testingPhenotypeNeuroimagingGenetic heterogeneityMagnetic resonance imaging
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic leukoencephalopathies are considered rare in the adult population. However, several lines of evidence suggest that there is a larger than expected number of adult patients with genetic leukoencephalopathies who are currently not diagnosed. The study of leukoencephalopathies - either genetically-proven or unsolved - relies greatly on MRI pattern-recognition, which allowed the characterization of the majority of genetic white matter disorders. The advent of next generation sequencing (NGS) revolutionized the field, by disclosing new phenotypes associated to known genetic white matter conditions and identifying novel genes responsible for unsolved leukoencephalopathies. The goals of my study were1.the application of advanced neuroimaging tools to define and characterize white matter abnormalities of known and novel genetic leukoencephalopathies2.the clinical and demographic characterization of subjects with adult genetic leukoencephalopathies3.the identification of genes responsible for new forms of hereditary white matter disorders, using NGS techniques.We applied an integrated approach which combined clinical phenotyping with MRI pattern-recognition and NGS data. This work led to a) the description of a cohort of 68 adult subjects with leukoencephalopathy of probable genetic origin, 59 of which were included in our study, b) the identification of the causal mutations (16 in total, 11 novel) in genes known to be associated with leukoencephalopathies in 14/59 subjects (23.7%), and c) the broadening of clinical and imaging phenotypes of known disorders: POLR3-related disorders, vanishing white matter disease, Krabbe disease, MTFMT-related disorders. We demonstrated that MRI family studies can be crucial in adult leukoencephalopathies to define the modality of transmission of unclear white matter disorders within families. In conclusion, we documented that adult genetic leukoencephalopathies are an emerging problem in clinical neurosciences. MRI family studies and the recognition of disease-specific MRI features are critical to guide the diagnostic process. Despite the access to NGS techniques, more than 70% of our subjects remain without a diagnosis. The international sharing of MRI and NGS on adult leukoencephalopathies will allow the identification of subjects with same phenotypes or mutated genes and ultimately lead to the description of new genetic entities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeScholarship@McGill (McGill)Même sujetRNA regulation and diseaseTravaux en français237 207