Discovery and Biochemical Characterization of New CAZymes from PULs and Metagenome Sequences
Notice bibliographique
Résumé
(methyl)-Glucuronoxylan, a main hemicellulose in hardwood trees, has a broad range of potential applications, ranging from biofuels to bio-based coatings and packaging films. It is substituted with (methyl)glucuronic ((Me)GlcpA) and acetic acids, which affect polymer solubility, rheology, interaction with other polymers, and accessibility of the polymer to enzymes. To date, there are no known esterases that are able to deacetylate internal xylose residues that are both 3-O-acetylated and 2-O substituted with (Me)GlcpA (Xyl-3-Ac-2MeGlcpA). In this study a protein of unknown function, which was named FjoAcXE, was produced and characterized to be an acetyl xylan esterase capable of deacetylating xylose residues at all positions, including Xyl-3-Ac-2MeGlcpA. Additionally, FjoAcXE was shown to display synergism with α-glucuronidases from glycoside hydrolase (GH) 67 and GH115 families. Synergistic action between FjoAcXE with α-glucuronidases was further tested with three recombinantly produced α-glucuronidases from metagenomic sequences of the Canadian beaver (Castor Canadensis) droppings enriched on poplar hydrolysate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».