NOD2 and Mycobacteria
Notice bibliographique
Résumé
The genus Mycobacterium comprises a variety of highly successful intracellular pathogens. Mycobacterium tuberculosis is the causative agent of tuberculosis (TB) in humans and currently infects one third of the world's population. Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis is the established cause of Johne's disease in ruminants and is epidemiologically associated with Crohn's disease (CD) in humans. Both TB and CD are complex genetic diseases for which immunological pathways associated with disease susceptibility or resistance have been identified based on human genetic studies. Common polymorphisms in NOD2 have recently been described to predispose to CD. NOD2 encodes a receptor of the Nod-like receptor (NLR) family involved in mediating innate immunity upon recognition of fragments of bacterial peptidoglycan (PGN), a structural component of most bacterial cell wall. CD-associated NOD2 polymorphisms were shown to abrogate this response. While recent studies have uncovered an important role of NOD2 for the recognition of mycobacterial species, the consequences and significance of this recognition remain obscure. The first part of the work presented in this thesis investigates the consequences of NOD2-mediated recognition on innate responses, adaptive immunity and resistance to mycobacterial infection. Using Nod2-deficient mice as a model to study CD-associated NOD2 mutations in humans, we show that the NOD2 pathway is critical for both innate and acquired anti-mycobacterial immunity. Impaired mycobacterial recognition at early time points following infection altered the immunopathology in the lungs and resulted in decreased survival of Nod2-deficient mice when virulent M. tuberculosis was given by aerosol. The second part of this thesis focuses on the biochemical basis of mycobacterial recognition by NOD2. The bacterial N-acetylmuramic acid hydroxylase (NamH) enzyme introduces a specific modification in PGN. We correlated the presence of this enzyme in mycobacteri
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».