Rapid and sensitive detection of viable mycobacteria in bovine faeces and blood by a novel phagomagnetic separation (PhMS)-qPCR assay
Notice bibliographique
Résumé
<i>Mycobacterium avium</i> subsp.<i> paratuberculosis </i>(MAP) and <i>Mycobacterium bovis</i> are slow-growing mycobacterial pathogens that cause Johne’s disease (Paratuberculosis) and Bovine Tuberculosis, respectively. The potential of a new Phagomagnetic separation (PhMS)-qPCR assay to detect viable MAP and/or M. bovis in bovine faeces and blood within 24 h was investigated. Following careful optimization of sample preparation protocols, faeces samples (n=376) from calves and adult cattle on several Johne’s affected farms, and blood samples (n=174) from TB skin test reactor and routine slaughter <30 month old cattle collected at point of slaughter, were tested by PhMS-qPCR and culture. Results of faecal testing demonstrate that the novel PhMS-qPCR assay can quickly detect calves or cattle shedding viable MAP, i.e. infectious animals. Results of blood testing revealed that viable MAP and/or <i>M. bovis</i> mycobacteraemias were readily detectable in cattle at slaughter in Northern Ireland, with co-infections (both MAP and M. bovis detected in same blood sample) frequently encountered. Collectively, results indicate that the novel PhMS-qPCR assays may represent new diagnostic tests for Johne’s disease and bovine Tuberculosis in the future. <br/>
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».