Characterization of Clostridium difficile from patients in Ontario hospitals
Notice bibliographique
Résumé
The characteristics of 'Clostridium diffiile' strains recovered from patients in Ontario healthcare facilities were studied. ' Clostridium difficile' toxin ELISA positive fecal samples were collected from 21 Ontario healthcare facilities between March 2005 and April 2006. Positive isolates were obtained from 1080/1152 (94%) samples, and were PCR-ribotyped. Presence of 'C. difficile' toxins A, B and CDT ribotypes was determined. Antimicrobial susceptibility was tested with the antimicrobials metronidazole, vancomycin, levofloxacin and clindamycin using E-tests. Presence of 'tcdC' gene deletion and toxinotyping was performed on all 39 distinct ribotypes. One ribotype accounted for 25% of isolates, while ribotype 027/NAP1, an internationally recognized outbreak strain, accounted for 19% of isolates. CDT prevalence was unexpectedly high (34.8%), and 6 ribotypes had a deletion in the 'tcdC' gene. One isolate showed reproducible metronidazole resistance but resistance was eventually lost during serial passage culture. 1080, 1076 and 0 isolates were susceptible to vancomycin, clindamycin and levofloxacin respectively.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».