Defense gene expression in corn (Zea mays L.) in response to Clavibacter nebraskensis, the causal agent of Goss’s Wilt and Leaf Blight
Notice bibliographique
Résumé
Goss’s wilt and leaf blight is a growing concern for corn growers in Manitoba, Canada. Little is known about the genetic interaction between corn and the bacterial pathogen, Clavibacter nebraskensis (Cn). The objective of this study was to investigate at the molecular level, how corn can defend against Cn. Two lines of corn screened as susceptible (CO447) and tolerant (CO450) to Goss’s wilt and leaf blight, respectively, were inoculated with Cn strains that possess different aggressiveness levels. The highly aggressive Cn strain (CMN14-5-1) produced severe symptoms on CO447, which quickly developed water soaked lesions, and then within a couple days, developed into necrotic lesions. However, symptoms on CO450 exhibited signs of chlorosis, freckling, and necrosis that did not progress, beyond the initial 6 days after inoculation, with the same strains, which were signs of programmed cell death (PCD) within the corn plant. Similar results were observed with the less aggressive Cn strain (DOAB232), though symptoms were less severe. Area under disease progress curve values were estimated for both lesion length and disease severity, which yielded significant differences amongst treatments. Analysis of the expression of 31 genes associated with plant defense was performed on plants challenged with each Cn strain. Four genes, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPI), ras-related protein 7 (Rab7), ribosome-inactivating proteins (RIP2), and respiratory burst oxidase homolog protein D (rbohD) were upregulated in CO450 RbohD is one of the genes responsible for reactive oxygen species (ROS) production, a key factor in PCD, so can be considered a defense factor in this study. Four genes, jasmonate-zim-domain protein 20 (jaz20), β subunit ATP synthase (βATP), allene oxide synthase (ZmAOS), and guanosine triphosphate (GTP)-binding protein (RabE1C) were upregulated in CO447. Based on their differential expression in the two corn lines in response to one or the strain, some genes may be suggested as contributors to either susceptibility or tolerance to Goss’s wilt and leaf blight. Along with other findings in Drs. Daayf, Tambong, and Stasolla’s lab, this knowledge can represent a foundation for developing cultivars with higher resistance to Cn.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».