The effects of the SCCmec element and colony spreading on the virulence of methicillin resistant Staphylococcus aureus in a nematode model
Notice bibliographique
Résumé
Methicillin resistant Staphylococcus aureus presents clinical challenges. The ability of S. aureus to cause human disease is correlated with the nematocidal activity of that isolate. This thesis investigates the relationship between SCCmec type, colony spreading, and the presence of the fudoh/psm-mec region of MRSA isolates to their ability to kill Caenorhabditis elegans. PCR was used to test for the fudoh/psm-mec region in 420 CMRSA2 isolates and 155 CMRSA1 isolates. Spread plate assays were performed on 149 CMRSA2 isolates to determine correlation between SCCmec type and colony spreading. Fudoh/psm-mec was correlated with the infection/colonization status of a patient. SCCmec type IV was correlated with increased spreading ability. SCCmec type, PFGE type, spa type, and colony spreading ability of 40 MRSA isolates were determined; these isolates were characterized using a nematode killing assay. It was found that the colony spreading ability of an isolate correlated with the nematocidal ability of that isolate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».