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Enregistrement W7055884849

Developmental expression analysis and RNA interference (RNAi) screen of putative neuromuscular receptors of «Schistosoma mansoni»

2014· dissertation· en· W7055884849 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueThermal properties of materials
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMinistry of Education, India
Mots-clésReceptorRNA interferencePhenotypeRNASchistosoma mansoniMotilityFunction (biology)G protein-coupled receptor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In parasitic platyhelminths, including Schistosoma mansoni the coordination of neuromuscular system is critical for continued propagation, development and successful completion of the lifecycle.Neuromuscular signaling in these parasites is mediated by a variety of neurotransmitters, both small molecules ("classical") transmitters and neuropeptides.Biogenic amines (BA) constitute the largest subset of classical neurotransmitters and play several key roles in the control of schistosome muscle function and movement.There are several putative BA receptors identified in the S. mansoni genome, the majority of which are Class A G protein coupled receptors (GPCRs).Here we report the functional role of these putative BA receptors in parasite development and motility by developmental expression analysis and RNAi screening.We performed an expression analysis of several putative BA receptors at the RNA level in different developmental stages of the parasite, using reverse-transcription coupled to quantitative PCR (RT-qPCR).One of these proteins is a previously described serotonin receptor of S. mansoni (named Sm5HTR) and the others are novel "orphan" BA-like receptors.The analysis showed that the BA receptors tested are expressed in all developmental stages, however the majority are preferentially expressed in cercaria and schistosomula, suggesting these receptors play particularly important roles in parasite larvae.Next we performed RNA interference (RNAi) targeting the same BA receptors by transfecting S.mansoni larvae with small interfering RNA (siRNA) and analyzed for effects on motor activity by comparing with the control groups.Given that BAs are known modulators of schistosome movement, we hypothesized that the RNAi would produce a motor phenotype in the larvae and this was confirmed by the data.The results identified strongly hypoactive phenotypes for three out of four receptors tested, including Sm5HTR (Smp_126730), Smp_150180 and Smp_120620), all showing significant reduction in movement compared to control larvae transfected with irrelevant (scrambled) siRNAs.The RNAi phenotype correlated with a significant and specific knockdown in transcript levels as determined by RT-qPCR.To elucidate the mode of action of Sm5HTR we also performed confocal immunolocalization analysis using a specific peptide iii antibody.The expression pattern suggests Sm5HTR is highly abundant in the central and peripheral nervous system of the parasite, including the peripheral innervation of the body wall muscles responsible for movement.Together the results suggest that Sm5HTR and other BA receptors play an important role in the control of schistosome motility, particularly the larvae, and could be potential targets for new drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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