Development of gel and fluorescence based assays to monitor DNA cleavage, binding, and inhibition by the human cytomegalovirus terminase UL89-C
Notice bibliographique
Résumé
The terminase enzyme of the Human Cytomegalovirus (HCMV) is responsible for the packaging and cleaving of concatameric viral DNA during viral replication. Due to its vital role in the viral life cycle, the terminase enzyme has the potential to become a strong candidate for anti-viral treatments. Furthermore, there is no mammalian equivalent; therefore, drugs targeted to terminase-like proteins should be safe and highly selective.In order to study and screen potential inhibitors to the terminase enzyme, we developed gel-based DNA cleavage assays with a resolution of a single nucleotide, which allowed us to detect the precise cleavage of DNA substrates via the C-terminal nuclease domain of the UL89 terminase subunit (UL89-C). We then utilized these assays to screen compound libraries provided by various collaborators. Furthermore, we then attempted to develop a DNA binding assay to characterize the DNA binding ability of UL89-C, and its T4 bacteriophage homolog gp17, using fluorescence anisotropy. Thus, our results have not only important implications with regards to drug discovery efforts, but also shed light on the mechanisms of DNA binding and cleavage, drug action, and potential drug resistance. Furthermore, due to the conserved nature of the terminase nuclease, these active site inhibitors may have broad-spectrum anti-herpetic properties.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».