Expression analysis of low temperature-induced genes in wheat
Notice bibliographique
Résumé
Wheat (Triticum aestivum L.) is a widely adapted, economically important crop exhibiting winter, spring and intermediate growth habits.Winter wheat is seeded in the fall, over-winters, resumes growth in spring and is harvested in early summer.It also requires a period of low temperature (LT) exposure, experienced during the fall, to switch from the vegetative to reproductive phase in spring, a process known as vernalization.Low temperature also allows the wheat plant to cold-acclimate to withstand freezing winter temperatures.There has always been an interest to grow winter wheat because of its yield advantage over spring wheat.However, LT tolerance needs to be improved to prevent winter kill and maximize its yield potential.To achieve this more detailed understanding of molecular mechanisms underlying LT tolerance is required.Thus, objectives of this study were to determine the expression of a LT-induced gene and cDNA-AFLP profile in leaf and crown tissues of LT-exposed wheat plants.Survival of crown tissues after exposure to sub-zero temperatures is an indication of the level of LT tolerance of a cultivar.Thus, pattern and levels of expression of LT-induced genes and identification of LT-induced transcripts in this tissue will add to understanding of LT tolerance.Genotypes used in this study included a winter hardy cultivar, Norstar, a tender spring cultivar, Manitou and twonear-isogenic lines with the Vrn-A1 (spring Norstar) and vrn-A1 (winter Manitou) alleles of Manitou and Norstar, respectively.The dominant Vrn-A1 locus confers spring habit and therefore no requirement for vernalization.Quantitative real-time polymerase chain reaction (QPCR) for the cold-regulated gene, Wcor410, indicated that in leaf tissue the Vrn-A1 locus determined level of expression, being higher in the lines having the recessive vrn-A1 allele compared to the dominant Vrn-A1 allele lines.In the crown tissue, the Norstar genetic background led to the higher level of expression than in the Manitou background.cDNA-AFLP analysis also exhibited variable profiles between the two tissues.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,145 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».