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Enregistrement W7061477670

PmrAB-regulated LPS phosphoethanolamine modifications have multiple roles in «Citrobacter rodentium»

2015· dissertation· en· W7061477670 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdaptive optics and wavefront sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésImmune systemEnzymeIdentification (biology)Context (archaeology)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gram-negative bacteria have the ability to modify their lipopolysaccharide (LPS) in response to changing environmental conditions.The principal regulator of LPS modifications in the Enterobacteriaceae is the PmrA-PmrB (PmrAB) two-component system, which is activated by micromolar concentrations of Fe 3+ and Al 3+ and mildly acidic pH.PmrAB mediates the transcription of pmrC and cptA, encoding phosphoethanolamine (pEtN) transferases that catalyze the addition of pEtN to the 1-and 4'-phosphoryl groups of the lipid A moiety and to the phosphoryl group of heptose-I of the core moiety of LPS, respectively.The first objective was to determine if PmrC-and CptA-mediated pEtN modifications play a role in maintaining outer membrane integrity in C. rodentium under PmrAB-inducing conditions.To assess the role of pEtN modifications in outer membrane integrity, C. rodentium ∆pmrAB, ∆pmrC, ∆cptA and ∆pmrC∆cptA strains were generated.The ∆pmrC, ∆pmrC∆cptA and ∆pmrAB demonstrated increased susceptibility to hydrophobic antibiotics, whereas only the ∆pmrC∆cptA and ∆pmrAB strains displayed a loss of OM integrity under PmrAB-inducing conditions.The second objective was to determine the mechanism by which PmrC-and CptA-mediated pEtN modifications maintain outer membrane integrity under PmrAB-inducing conditions.Whole-cell lysate LPS extractions performed on ∆waaL strains grown in the presence of micromolar concentrations of iron demonstrated that the ∆waaL∆pmrC∆cptA strain accumulates free lipid A, which is a measure of a defect in LPS turnover.Using sucrose density gradient centrifugation, it was shown that the ∆waaL∆pmrC∆cptA strain accumulated LPS throughout its cell envelope in the presence of micromolar iron, whereas the ∆waaL strain had most of its LPS in the fractions corresponding to the outer membrane, suggesting that pEtN modifications are involved in the transfer of LPS from the IM to the OM.The third objective was to determine whether the response to iron results in the formation of OM vesicles (OMVs).It was determined that OM vesiculation does occur in the ix CONTRIBUTIONS TO ORIGINAL SCIENTIFIC KNOWLEDGE 1.We show that PmrC and CptA maintain OM integrity in C. rodentium.2. We demonstrate that PmrC and CptA confer resistance to hydrophobic antibiotics.3. We show that PmrC and CptA promote lipid A turnover.4. We demonstrate that lack of PmrC and CptA results in free lipid A accumulation in the presence of iron.5. We demonstrate that PmrC and CptA promote transfer of LPS to the OM. 6.We show that iron increases Gram-negative bacterial resistance to hydrophobic antibiotics in a concentration-dependent manner.7. We demonstrate that iron promotes OM vesiculation.8.We show that PmrC and CptA confer protection against OMVs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
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