Temperate Phage-Antibiotic Synergy
Notice bibliographique
Résumé
The escalating threat of antimicrobial resistance has intensified the exploration of alternative treatments, with bacteriophage (phage) therapy emerging as a potential substitute for antibiotics. While strictly lytic phages rapidly kill bacteria, temperate phages can also go dormant in their hosts. Accordingly, despite their prevalence, they are considered unsuitable for therapy. My systematic review of phage therapy in urinary tract infections (UTIs) highlighted this. This review motivated me to explore how the potential of these phages could be leveraged. Chapter 3 introduces a novel strategy to do so, exploring whether the fluoroquinolone antibiotic ciprofloxacin could synergize with temperate phages. This innovative strategy exploits the ability of the antibiotic to awaken dormant temperate phages, driving a potent synergy (≥8 log reduction) able to result in bacterial eradication. This is a potential breakthrough in the use of phages. Chapter 4 expands on this finding, establishing that a synergy exists across various drug classes with diverse mechanisms of action. Surprisingly, the synergy extends beyond antibiotics triggering the bacterial SOS-response known to wake temperate phages and also includes protein synthesis inhibitors, offering a new approach to influence the phage lysis-lysogeny decision. Chapter 5 explores the identified synergy in antibiotic-resistant models, focusing on the impact of antibiotic resistance on the effect of combining temperate phages with antibiotics. While the majority of cases demonstrated synergy comparable to the absence of antibiotic resistance, an exception was noted in the acetylation-resistant models for both gentamicin and ciprofloxacin. These resistance genes abolished synergy with the temperate phage, emphasizing the importance of the resistance mechanism within temperate phage antibiotic synergy (tPAS). In conclusion, this thesis underscores the lack of interest in temperate phages for therapy and demonstrates a scalable strategy to overcome the major barriers to their use. I uncover the mechanisms underlying the synergy and show that these concepts are applicable even in the context of resistance to the synergizing antibiotic. These findings propose a remarkable shift in how antimicrobial therapy approaches are viewed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».