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Enregistrement W7062826271

Undescribed novel roles for fascin in cancer cell biology

2017· dissertation· en· W7062826271 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2017
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueHeat Transfer and Numerical Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésFascinCancerCancer cellCellCell growthCell culture
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L'intégrité du cytosquelette cellulaire est essentielle pour les fonctions physiologiques multiples requises pour le maintien de l'homéostasie tissulaire tel que la morphologie, la polarité, la contractilité, la division, la locomotion, ainsi que le trafic intracellulaire de molécules de signalisation. La régulation du cytosquelette est médiée par un ensemble collectif de protéines de liaison et de réticulation de l'actine, qui servent de médiateur à la ramification des filaments d'actine en réseaux étroitement organisés. Une classe majeure de protéines d'agrégation d'actine est représentée par la famille Fascin, qui comprend Fascin-1, puis Fascin), -2 et -3.Fascin fonctionne comme une protéine de liaison d'actine qui réticule l'actine corticale en faisceaux filamenteux parallèles et participe à l'ancrage des récepteurs membranaires au cytosquelette d'actine. Elle est principalement exprimée dans le système nerveux mais surtout principalement absente des cellules épithéliales normalement différenciés. Dans des conditions pathologiques telles que le cancer, Fascin est surexprimé, incluant des carcinomes du sein. De plus, dans de nombreux cas, une association entre sa surexpression et un mauvais pronostic du patient a été observée.Les études biochimiques et la localisation à grande échelle du génome utilisant ChIP-seq ont identifié Fascin 1 phosphorylée (pFascin) en tant que partenaire d'interaction de l'ARN polymérase II et qu'elle co-localise avec H3K4me3 sur la chromatine. Le profilage d'expression génique a identifié des gènes affectés par Fascin 1 incluant SLC3A2. En outre, l'analyse ChIP a révélé une perte significative de H3K4me3 chez des gènes cibles dans des cellules où l'expression de Fascin était faible. RbBP5, une sous-unité du complexe H3K4 histone méthyltransférase (HMT), interagit également avec Fascin 1 en soutenant son rôle dans l'établissement de H3K4me3 chez les gènes cibles impactant positivement la transcription. De plus, nous montrons que la régulation de SLC3A2 par Fascin affecte l'activation de mTORC1 par les acides aminés.De plus, nous montrons à travers des résultats préliminaires que la perte de Fascin, à travers la technologie CRISPR, a un impact négatif sur les niveaux de protéines des composants du complexe mTORC1 conduisant à l'induction de l'autophagie.Enfin, nous avons également constaté que les souris ayant perdues Fascin ne sont pas viables.En conclusion, nos résultats étayent des fonctions nucléaires et cytoplasmiques multiples, non encore décrite, pour Fascin dans la régulation de processus cellulaires primordiaux pour la biologie cellulaire in vitro et établissent l'essentialité du gène Fscn1 in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
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