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Record W7062826271

Undescribed novel roles for fascin in cancer cell biology

2017· dissertation· en· W7062826271 on OpenAlexfundno aff

Bibliographic record

VenueeScholarship@McGill (McGill) · 2017
Typedissertation
Languageen
FieldEngineering
TopicHeat Transfer and Numerical Methods
Canadian institutionsnot available
FundersMcGill University
KeywordsFascinCancerCancer cellCellCell growthCell culture
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

L'intégrité du cytosquelette cellulaire est essentielle pour les fonctions physiologiques multiples requises pour le maintien de l'homéostasie tissulaire tel que la morphologie, la polarité, la contractilité, la division, la locomotion, ainsi que le trafic intracellulaire de molécules de signalisation. La régulation du cytosquelette est médiée par un ensemble collectif de protéines de liaison et de réticulation de l'actine, qui servent de médiateur à la ramification des filaments d'actine en réseaux étroitement organisés. Une classe majeure de protéines d'agrégation d'actine est représentée par la famille Fascin, qui comprend Fascin-1, puis Fascin), -2 et -3.Fascin fonctionne comme une protéine de liaison d'actine qui réticule l'actine corticale en faisceaux filamenteux parallèles et participe à l'ancrage des récepteurs membranaires au cytosquelette d'actine. Elle est principalement exprimée dans le système nerveux mais surtout principalement absente des cellules épithéliales normalement différenciés. Dans des conditions pathologiques telles que le cancer, Fascin est surexprimé, incluant des carcinomes du sein. De plus, dans de nombreux cas, une association entre sa surexpression et un mauvais pronostic du patient a été observée.Les études biochimiques et la localisation à grande échelle du génome utilisant ChIP-seq ont identifié Fascin 1 phosphorylée (pFascin) en tant que partenaire d'interaction de l'ARN polymérase II et qu'elle co-localise avec H3K4me3 sur la chromatine. Le profilage d'expression génique a identifié des gènes affectés par Fascin 1 incluant SLC3A2. En outre, l'analyse ChIP a révélé une perte significative de H3K4me3 chez des gènes cibles dans des cellules où l'expression de Fascin était faible. RbBP5, une sous-unité du complexe H3K4 histone méthyltransférase (HMT), interagit également avec Fascin 1 en soutenant son rôle dans l'établissement de H3K4me3 chez les gènes cibles impactant positivement la transcription. De plus, nous montrons que la régulation de SLC3A2 par Fascin affecte l'activation de mTORC1 par les acides aminés.De plus, nous montrons à travers des résultats préliminaires que la perte de Fascin, à travers la technologie CRISPR, a un impact négatif sur les niveaux de protéines des composants du complexe mTORC1 conduisant à l'induction de l'autophagie.Enfin, nous avons également constaté que les souris ayant perdues Fascin ne sont pas viables.En conclusion, nos résultats étayent des fonctions nucléaires et cytoplasmiques multiples, non encore décrite, pour Fascin dans la régulation de processus cellulaires primordiaux pour la biologie cellulaire in vitro et établissent l'essentialité du gène Fscn1 in vivo.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.007
Threshold uncertainty score0.023

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0010.001
Scholarly communication0.0010.001
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0070.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.040
GPT teacher head0.310
Teacher spread0.270 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Published2017
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