Caracterização genômica e fenotípica de isolados de Brucella canis
Notice bibliographique
Résumé
A Brucella canis, causadora da brucelose, é um patógeno listado pelo Organização Mundial da Saúde Animal (WOAH) como uma das zoonoses emergentes negligenciadas na atualidade. É responsável por perdas econômicas, assim como problemas de saúde pública. Estima-se que haja meio milhão de casos de brucelose ao ano no mundo, sendo destes, 1% causados pela B. canis. Apesar disso, ainda há poucos estudos acerca do perfil genômico e quanto ao perfil de susceptibilidade a antimicrobianos para esta bactéria. Por isso, esse trabalho tem como objetivo realizar a caracterização genômica e fenotípica de 19 isolados de B. canis isolados de caninos do sul do Brasil entre os anos de 1995 a 2015. Para isso, realizou-se análises in sílico e in vitro. Para a caracterização genômica e filogenética, realizou-se a montagem híbrida das reads brutas geradas através de dois sequenciadores de última geração distintos. Para os testes de susceptibilidade in vitro, determinou-se a concentração inibitória mínima (CIM) e concentração bactericida mínima (CBM) dos isolados frente a quatro antimicrobianos. Através das análises genômicas, detectou-se a presença de dois genes de resistência a antimicrobianos em todos os isolados, denominados DNA gyrase subunit A (gyrA) e Alanyl phosphatidylglycerol synthase (A-PGS). Além disso, as análises filogenéticas demonstraram o predomínio do sequence type 20 (ST20) entre as cepas desse estudo, assim como a delimitação de duas linhagens de B. canis distintas baseada em SNPs. Quanto ao perfil de susceptibilidade a antimicrobianos, os isolados do presente estudo demonstraram um perfil semelhante entre eles, onde a gentamicina foi a droga mais eficaz nos ensaios in vitro. Por fim, os resultados obtidos através desse trabalho contribuem com informações acerca do perfil genômico e filogenético de isolados de B. canis do sul do Brasil, possibilitando novas perspectivas de tratamento e prevenção para a brucelose canina.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».