Caracterização genômica e fenotípica de isolados de Brucella canis
Bibliographic record
Abstract
A Brucella canis, causadora da brucelose, é um patógeno listado pelo Organização Mundial da Saúde Animal (WOAH) como uma das zoonoses emergentes negligenciadas na atualidade. É responsável por perdas econômicas, assim como problemas de saúde pública. Estima-se que haja meio milhão de casos de brucelose ao ano no mundo, sendo destes, 1% causados pela B. canis. Apesar disso, ainda há poucos estudos acerca do perfil genômico e quanto ao perfil de susceptibilidade a antimicrobianos para esta bactéria. Por isso, esse trabalho tem como objetivo realizar a caracterização genômica e fenotípica de 19 isolados de B. canis isolados de caninos do sul do Brasil entre os anos de 1995 a 2015. Para isso, realizou-se análises in sílico e in vitro. Para a caracterização genômica e filogenética, realizou-se a montagem híbrida das reads brutas geradas através de dois sequenciadores de última geração distintos. Para os testes de susceptibilidade in vitro, determinou-se a concentração inibitória mínima (CIM) e concentração bactericida mínima (CBM) dos isolados frente a quatro antimicrobianos. Através das análises genômicas, detectou-se a presença de dois genes de resistência a antimicrobianos em todos os isolados, denominados DNA gyrase subunit A (gyrA) e Alanyl phosphatidylglycerol synthase (A-PGS). Além disso, as análises filogenéticas demonstraram o predomínio do sequence type 20 (ST20) entre as cepas desse estudo, assim como a delimitação de duas linhagens de B. canis distintas baseada em SNPs. Quanto ao perfil de susceptibilidade a antimicrobianos, os isolados do presente estudo demonstraram um perfil semelhante entre eles, onde a gentamicina foi a droga mais eficaz nos ensaios in vitro. Por fim, os resultados obtidos através desse trabalho contribuem com informações acerca do perfil genômico e filogenético de isolados de B. canis do sul do Brasil, possibilitando novas perspectivas de tratamento e prevenção para a brucelose canina.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.002 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.001 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.002 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.001 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.002 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".