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Enregistrement W7064782291

The Characterization of Baxb, a Splice Variant of the Pro-Apoptotic Bax and Protein

2001· dissertation· en· W7064782291 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueMacSphere (McMaster University) · 2001
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcMaster UniversityMoffitt Cancer CenterUniversity of Pennsylvania
Mots-clésTransfectionGene isoformAlternative splicingspliceProgrammed cell deathEpitopeHEK 293 cellsTransmembrane domainTransmembrane proteinRNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Baxa is a pro-apoptotic member of the Bcl-2 protein family that regulates a key point in the control of apoptosis. The bax RNA undergoes a complex pattern of RNA splicing, with eight splice isoforms known to date. The next most abundant isoform to Baxa is Baxp, which has a unique carboxyl-terminal sequence and consequently lacks the transmembrane domain of Baxa. This study characterized Baxp as part of a larger project aimed at deducing the role of cellular localization in Bax protein function. A transient transfection assay was designed to determine the cell death activity of a protein in adherent cells. Baxp induced cell death to a greater extent than Baxa when transiently expressed in NIH 3T3 cells. The levels of Baxp expression were always low, regardless of the cell type or transfection method used. Additionally, Baxp adopted a conformation in which amino acids 13 to 19 are accessible to the monoclonal antibody 6A7. In Baxa this epitope is only exposed in the membrane-bound activated conformation that is associated with accessibility of the BH3 domain of Baxa that mediates protein-protein interactions among Bcl-2 family members. Although the mechanism remains elusive, Baxp was identified as a potent inducer of cell death.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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